RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.28□□□□□ -1.56
ZNF548-208ENST00000597576 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.28□□□□□ -1.56
ZNF548-208ENST00000597576 TSHBP01222 138 aa5.28□□□□□ -1.56
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ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3-33P01772 117 aa5.28□□□□□ -1.56
ZNF548-208ENST00000597576 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
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ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.28□□□□□ -1.56
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ZNF548-208ENST00000597576 LINC01545Q5VT33 79 aa5.27□□□□□ -1.57
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ZNF548-208ENST00000597576 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.27□□□□□ -1.57
ZNF548-208ENST00000597576 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.27□□□□□ -1.57
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ZNF548-208ENST00000597576 GAS8-AS1O95177 125 aa5.26□□□□□ -1.57
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ZNF548-208ENST00000597576 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.26□□□□□ -1.57
ZNF548-208ENST00000597576 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.26□□□□□ -1.57
ZNF548-208ENST00000597576 KLK12Q9UKR0 248 aa5.26□□□□□ -1.57
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ZNF548-208ENST00000597576 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
ZNF548-208ENST00000597576 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.25□□□□□ -1.57
ZNF548-208ENST00000597576 ATP5LO75964 103 aa5.25□□□□□ -1.57
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ZNF548-208ENST00000597576 UBE2WQ96B02 151 aa5.25□□□□□ -1.57
ZNF548-208ENST00000597576 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.25□□□□□ -1.57
ZNF548-208ENST00000597576 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.25□□□□□ -1.57
ZNF548-208ENST00000597576 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.25□□□□□ -1.57
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ZNF548-208ENST00000597576 C14orf177Q52M58 125 aa5.22□□□□□ -1.57
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ZNF548-208ENST00000597576 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.22□□□□□ -1.57
ZNF548-208ENST00000597576 TIMM17AQ99595 171 aa5.22□□□□□ -1.57
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ZNF548-208ENST00000597576 PRR34Q9NV39 138 aa5.22□□□□□ -1.57
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ZNF548-208ENST00000597576 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.2□□□□□ -1.58
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.2□□□□□ -1.58
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ZNF548-208ENST00000597576 PLNP26678 52 aa5.2□□□□□ -1.58
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ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.2□□□□□ -1.58
ZNF548-208ENST00000597576 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.2□□□□□ -1.58
ZNF548-208ENST00000597576 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.19□□□□□ -1.58
ZNF548-208ENST00000597576 ENHOQ6UWT2 76 aa5.19□□□□□ -1.58
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZUT4 128 aa5.19□□□□□ -1.58
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.18□□□□□ -1.58
ZNF548-208ENST00000597576 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.18□□□□□ -1.58
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.18□□□□□ -1.58
ZNF548-208ENST00000597576 hDV102S1A0JD36 115 aa5.18□□□□□ -1.58
ZNF548-208ENST00000597576 IGIPA6NJ69 53 aa5.18□□□□□ -1.58
ZNF548-208ENST00000597576 F8VRH5 84 aa5.18□□□□□ -1.58
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