RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 LECT2O14960 151 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 IGKCP01834 107 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 TIRAPP58753 221 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 TIMM17AQ99595 171 aa10.05□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 hDV102S1A0JD36 115 aa10.04□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 SMAGPQ0VAQ4 97 aa10.04□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 ODF1Q14990 250 aa10.04□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 C10orf126Q8N4M7 172 aa10.04□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa10.04□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 Q9UF83 564 aa10.04□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.03□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 CHAC1Q9BUX1 264 aa10.03□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
POLR2E-210ENST00000592597 F8VRH5 84 aa10.02□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 M0R143 59 aa10.02□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 TSHBP01222 138 aa10.02□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 NPSP0C0P6 89 aa10.02□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 COTL1Q14019 142 aa10.02□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 MAJINQ3KP22 176 aa10.02□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.02□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.01□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 PMVKQ15126 192 aa10.01□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.01□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 C14orf144Q96I85 54 aa10.01□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa10.01□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 GAGE12JA6NER3 117 aa10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 UBE2D3P61077 147 aa10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 UBE2D2P62837 147 aa10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 GAGE1Q13065 139 aa10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 GAGE4Q13068 117 aa10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 GAGE5Q13069 117 aa10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 GAGE13Q4V321 117 aa10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 BAALCQ8WXS3 180 aa10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 GTSF1LQ9H1H1 148 aa10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 IGIPA6NJ69 53 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 COX8AP10176 69 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 IGHV3-30P01768 117 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 IGHV3-33P01772 117 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 HERVK_113P61574 105 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 VCX2Q9H322 139 aa9.97□□□□□ -0.81
POLR2E-210ENST00000592597 DLEU1O43261 78 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 CTAG1AP78358 180 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 LELP1Q5T871 98 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 CST9LQ9H4G1 147 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 NMUP48645 174 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 STPG4Q8N801 248 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.93□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 H7C423 109 aa9.92□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.92□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 Q8N3U1 123 aa9.92□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.92□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 TM2D2Q9BX73 214 aa9.92□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 LPAP08519 4548 aa9.91□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.91□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.91□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.91□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 UBE2L6O14933 153 aa9.91□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.9□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 TMEM243Q9BU79 118 aa9.9□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.9□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.9□□□□□ -0.82
POLR2E-210ENST00000592597 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.89□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 C11orf86A6NJI1 115 aa9.89□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 BATFQ16520 125 aa9.89□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.89□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.89□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 TMEM101Q96IK0 257 aa9.89□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 E9PLD3 99 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 AMELXQ99217 191 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 FGF6P10767 208 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR2E-210ENST00000592597 SEC11AP67812 179 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91 ms