RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 AP1S3Q96PC3 154 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 OSTCQ9NRP0 149 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 M0QY20 66 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 PSCAO43653 123 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 C6orf99Q4VX62 202 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01551Q86U37 167 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 NIT1Q86X76 327 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM243Q9BU79 118 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 CNFNQ9BYD5 112 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 NIT2Q9NQR4 276 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A087WX48 190 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GXF2 115 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 C16orf90A8MZG2 172 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 MGPP08493 103 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB14P61106 215 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 PKIAP61925 76 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 C4orf26Q17RF5 130 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 RASL11AQ6T310 242 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 TSKUQ8WUA8 353 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 FRZBQ92765 325 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 BORCS7Q96B45 105 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 TIMM17AQ99595 171 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 NAT8Q9UHE5 227 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 PKD1P98161 4303 aa5□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A087WTM6 91 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 C9JQL5 133 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 CTRLP40313 264 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 NMUP48645 174 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 GATD1Q8NB37 220 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 RMI2Q96E14 147 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 KLK12Q9UKR0 248 aa4.99□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GUT8 65 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 Q0VG73 95 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 CEND1Q8N111 149 aa4.98□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 HIGD1CA8MV81 97 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 PMVKQ15126 192 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 ADIRFQ15847 76 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 IQCJQ1A5X6 159 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2WQ96B02 151 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 V9GYV3 84 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.97□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A0U1RQV1 116 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 Q8N976 141 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 NUP35Q8NFH5 326 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.96□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A087WYN8 130 aa4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM168BA1KXE4 195 aa4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 RBX1P62877 108 aa4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 ENHOQ6UWT2 76 aa4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 I3L3M4 83 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 NCR2O95944 276 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R17O96001 155 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 CRPP02741 224 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 CXCL5P42830 114 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 MIAQ16674 131 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 MPV17L2Q567V2 206 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 CLLU1Q5K131 121 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 Q8N814 137 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 ST20Q9HBF5 79 aa4.94□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00862A6NCI5 91 aa4.93□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2L6O14933 153 aa4.93□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
EFTUD2-216ENST00000590105 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms