RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.79□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.79□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.78□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 H3BMG7 143 aa5.78□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 COX6CP09669 75 aa5.78□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 DEFB1P60022 68 aa5.78□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.78□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 IL17DQ8TAD2 202 aa5.78□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.78□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 SPANXCQ9NY87 97 aa5.78□□□□□ -1.48
GGA3-218ENST00000584243 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 KNCNA6PVL3 124 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-30P01768 117 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 P0DMU3 169 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 FAM231AP0DMU4 169 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 FAM231CP0DMU5 169 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 INSL3P51460 131 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 UBE2D3P61077 147 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 UBE2D2P62837 147 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 HERV-K104P63124 156 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 JPT2Q9H910 190 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.76□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 K7EQD1 137 aa5.76□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 AZU1P20160 251 aa5.76□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 PCP4P48539 62 aa5.76□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 TMEM101Q96IK0 257 aa5.76□□□□□ -1.49
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GGA3-218ENST00000584243 TMEM262E9PQX1 116 aa5.75□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 K7ERJ3 54 aa5.75□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 EDN2P20800 178 aa5.75□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 RNF151Q2KHN1 245 aa5.75□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.75□□□□□ -1.49
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GGA3-218ENST00000584243 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.75□□□□□ -1.49
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GGA3-218ENST00000584243 SAP30O75446 220 aa5.74□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 TSPAN13O95857 204 aa5.74□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 IGLV1-51P01701 117 aa5.74□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.74□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 HTN1P15515 57 aa5.74□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 ATXN8Q156A1 80 aa5.74□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 MIAQ16674 131 aa5.74□□□□□ -1.49
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GGA3-218ENST00000584243 LINC01600Q96MT4 127 aa5.74□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.74□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.74□□□□□ -1.49
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GGA3-218ENST00000584243 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.73□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.73□□□□□ -1.49
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GGA3-218ENST00000584243 RTL8CO15255 209 aa5.73□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 APOMO95445 188 aa5.73□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 CFC1BP0CG36 223 aa5.73□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 CFC1P0CG37 223 aa5.73□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.73□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 MTURNQ8N3F0 131 aa5.73□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.73□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.72□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 A0A0J9YXV3 536 aa5.72□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.72□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 TEN1Q86WV5 123 aa5.72□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.72□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.72□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 TMEM243Q9BU79 118 aa5.72□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.72□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.72□□□□□ -1.49
GGA3-218ENST00000584243 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 SPRY2O43597 315 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 PSMB2P49721 201 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 SPATA25Q9BR10 227 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 XCL2Q9UBD3 114 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 A4D1N5 150 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 H3BT86 120 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-33P01772 117 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 EMP1P54849 157 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 Q1RN00 199 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 SIGMAR1Q99720 223 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 PRO0461Q9UI25 63 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 EPM2AB3EWF7 344 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 FAM222AQ5U5X8 452 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-218ENST00000584243 CARD19Q96LW7 228 aa5.69□□□□□ -1.5
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