RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 CLEC2BQ92478 149 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 C16orf74Q96GX8 76 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 MED13LQ71F56 2210 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 NBASA2RRP1 2371 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.11□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 CRLF1O75462 422 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 NPC2P61916 151 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 C10orf25Q5T742 122 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 COX7B2Q8TF08 81 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 ATRXP46100 2492 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 A0A1B0GX51 115 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 F5H768 121 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 XCL2Q9UBD3 114 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRM-212ENST00000580838 AKAP6Q13023 2319 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 A8MZ25 164 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 ATOX1O00244 68 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 UQCRQO14949 82 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 COX6A2Q02221 97 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 ITPR1Q14643 2758 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 DEFB136Q30KP8 78 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 H3BQ85 93 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 CCDC179H3BU77 68 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 CCL24O00175 119 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00158P58513 81 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 MUC7Q8TAX7 377 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 ASPMQ8IZT6 3477 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 A0A087WZ39 114 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00694P0DN24 101 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 SS18Q15532 418 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 Q6JHZ5 121 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 Q6ZSV7 163 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 Q6ZTI0 123 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 C5orf38Q86SI9 138 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 CREBBPQ92793 2442 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 NACAE9PAV3 2078 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 LAMA5O15230 3695 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 A0A0U1RRA0 63 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 Q9UF83 564 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 A0A1B0GUV1 79 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 NDUFA7O95182 113 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 NDUFC2O95298 119 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 LY6G6DO95868 133 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 PRM2P04554 102 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 COX7CP15954 63 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRM-212ENST00000580838 CCL18P55774 89 aa4.04□□□□□ -1.76
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