RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559143.1

MFGE8-209, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 358 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-209ENST00000559143 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-209ENST00000559143 A0A096LNJ9 63 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 hDV102S1A0JD36 115 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 F8WDY8 70 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 Q6ZSA8 131 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 A0A087WZ39 114 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 ATP5LO75964 103 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 MALP21145 153 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 KRTAP10-1P60331 282 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 HERVK_113P63121 156 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 PMVKQ15126 192 aa6□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 C2orf48Q96LS8 159 aa6□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.99□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.99□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.99□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 HSBP1O75506 76 aa5.99□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 SLPIP03973 132 aa5.99□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 C5orf38Q86SI9 138 aa5.99□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 BAGE3Q86Y29 109 aa5.99□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.98□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 SCO1O75880 301 aa5.98□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.98□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 CST9LQ9H4G1 147 aa5.98□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 RYR1P21817 5038 aa5.97□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.97□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.97□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 XGP55808 180 aa5.97□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 COX6A2Q02221 97 aa5.97□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 SPAG11BQ08648 103 aa5.97□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 RNF151Q2KHN1 245 aa5.97□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.97□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 CARD19Q96LW7 228 aa5.97□□□□□ -1.45
MFGE8-209ENST00000559143 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.96□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 SERF1AO75920 110 aa5.96□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 IGLC3P0DOY3 106 aa5.96□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00310P59036 64 aa5.96□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 SYCNQ0VAF6 134 aa5.96□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 PMCHL1Q16048 86 aa5.96□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.96□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.96□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 A0A0J9YXV3 536 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HIST1H2BKO60814 126 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HIST1H2BJP06899 126 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HIST1H2BOP23527 126 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HIST1H2BBP33778 126 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HIST1H2BDP58876 126 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HIST1H2BCP62807 126 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 KIAA0087Q14695 138 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 Q8IZM0 81 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.95□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 H3BRM9 83 aa5.94□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 NDUFA1O15239 70 aa5.94□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 LEPROTL1O95214 131 aa5.94□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 CXCL5P42830 114 aa5.94□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 LINC01620Q4KN68 170 aa5.94□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.94□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.94□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HERC2O95714 4834 aa5.93□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.93□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 HSPG2P98160 4391 aa5.93□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.93□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.93□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.93□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 Q6ZRU5 148 aa5.93□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 Q8N1X5 172 aa5.93□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.93□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.92□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 F8VRH5 84 aa5.92□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 PRSS2P07478 247 aa5.92□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 SCXQ7RTU7 201 aa5.92□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.92□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.92□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 NUPR1O60356 82 aa5.91□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 NDUFA6P56556 154 aa5.91□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.91□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
MFGE8-209ENST00000559143 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms