RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP10-9P60411 292 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 NCKAP5O14513 1909 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 LRP4O75096 1905 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0J9YX75 114 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 LY6LH3BQJ8 138 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 AVPP01185 164 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 MSMPQ1L6U9 139 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 WISP2O76076 250 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 PLCE1Q9P212 2302 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA1O15239 70 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 B9D2Q9BPU9 175 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1-39P01597 117 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1D-39P04432 117 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 K7EQG2 157 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 NCR3O14931 201 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV2-8P01709 118 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 KLKP1Q107X0 134 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 Q9H8V8 135 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 COX7B2Q8TF08 81 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 ERC2-IT1O76042 136 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1-17P01599 117 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 H0Y9J4 135 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV1-40P01703 118 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00208Q96KT6 92 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 REG3AQ06141 175 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 DSCAMO60469 2012 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N3U1 123 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 DIRC1Q969H9 104 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 FREM1Q5H8C1 2179 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GW54 56 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 H7BZZ5 65 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 PRR4Q16378 134 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 Q1T7F1 81 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00846Q9NV44 126 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRB-210ENST00000551525 P0C879 139 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf223Q8N319 242 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 A0A096LPF7 62 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV1-51P01701 117 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 HCFC1P51610 2035 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 COL4A2P08572 1712 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 CENPFP49454 3210 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0J9YXV3 536 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf90A8MZG2 172 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N2B8 174 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 KMT2EQ8IZD2 1858 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 PROK1P58294 105 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 DYSFO75923 2080 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 RITA1Q96K30 269 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 LELP1Q5T871 98 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 GNRH2O43555 120 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZS46 218 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRB-210ENST00000551525 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.55□□□□□ -1.68
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