RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 CEND1Q8N111 149 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 FHL2Q14192 279 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 HIGD1BQ9P298 99 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 CASC2Q6XLA1 102 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 GDF5OSQ5U4N7 250 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 PRYO14603 147 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 C5orf42Q9H799 3197 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 C12orf74Q32Q52 190 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 PTPRBP23467 1997 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 LECT2O14960 151 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf137Q5JT78 98 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 C10orf25Q5T742 122 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 PCSK5Q92824 1860 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 H3BT86 120 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 Q6ZRP5 223 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 DLEU1O43261 78 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 IGLC3P0DOY3 106 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 PCP2Q8IVA1 136 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 BPTFQ12830 3046 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 H3BMG7 143 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 ADCYAP1P18509 176 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GV72 72 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 LST1O00453 97 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 F8W1H4 67 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 J3KT08 172 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 BPY2O14599 106 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 CNFNQ9BYD5 112 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GXF2 115 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 FAM236CP0DP71 79 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 LAMA3Q16787 3333 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 K7EIL1 84 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 K7ERS5 55 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 TSHBP01222 138 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 CRYGAP11844 174 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 A0A0B4J2C4 111 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 C9orf118A6NHY6 69 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 IGKV4-1P06312 121 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 PYY3Q5JQD4 70 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 KLK9Q2XQG4 91 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV2-8P01709 118 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM223A0PJW6 202 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
PTPRB-209ENST00000550857 RTL8CO15255 209 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 NRACQ8N912 160 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 A0A096LNT2 108 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 A0A096LNI7 61 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 NDUFC2O95298 119 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00315P59091 139 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 COX6A2Q02221 97 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GV90 55 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV2-11P01706 119 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms