RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541175.1

PRR4-208, Transcript of proline rich 4, human

TSL 2

Gene PRR4, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-208	ENST00000541175	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175		A0A1W2PPV4	95 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	ZNF727	A8MUV8	499 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	SNAI2	O43623	268 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	CXCL1	P09341	107 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	CRIP1	P50238	77 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175		Q86TA4	180 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	SPRR2D	P22532	72 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	UPK1B	O75841	260 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	MOBP	Q13875	183 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	IGSF23	A1L1A6	192 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	RAB19	A4D1S5	217 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	IGKV2D-28	P01615	120 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	FAM236C	P0DP71	79 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	LIMD2	Q9BT23	127 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	C9orf170	A2RU37	121 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	TRGC1	P0CF51	173 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	PMCH	P20382	165 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	UBE2G1	P62253	170 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	C2orf82	Q6UX34	121 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	IFITM10	A6NMD0	228 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175		I3L3M4	83 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	PRSS2	P07478	247 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	FAM210A	Q96ND0	272 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	TPPP3	Q9BW30	176 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	TMEM126A	Q9H061	195 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	PEX7	O00628	323 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	AQP4	P55087	323 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	VBP1	P61758	197 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175		Q6ZVH6	145 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	CNBD2	Q96M20	576 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	TIMM17A	Q99595	171 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	RGS5	O15539	181 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	AP3S2	P59780	193 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	CKS1B	P61024	79 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	NEDD8	Q15843	81 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	FMC1	Q96HJ9	113 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	FAM25E	A8MYX2	175 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	GCHFR	P30047	84 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PRR4-208	ENST00000541175		A0A1W2PRE2	83 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	IFNA1	P01562	189 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	TEX261	Q6UWH6	196 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	GATD1	Q8NB37	220 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175		M0R378	163 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	LTA	P01374	205 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	STAG3L2	P0CL84	134 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	STAG3L3	P0CL85	134 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	LINC00483	Q53H64	154 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175		Q6ZUT4	128 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	AKAP14	Q86UN6	197 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PRR4-208	ENST00000541175	RAB26	Q9ULW5	256 aa		3.01	□□□□□ -1.93

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