RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 SPATA45Q537H7 98 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 CASC10Q5T4H9 136 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 ENHOQ6UWT2 76 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 IGKCP01834 107 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 XCL1P47992 114 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 UBE2WQ96B02 151 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 Q9H8V8 135 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 LINC01549A6NIU2 74 aa10.47□□□□□ -0.73
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TRPS1-206ENST00000517323 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-206ENST00000517323 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa10.46□□□□□ -0.74
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TRPS1-206ENST00000517323 SMAGPQ0VAQ4 97 aa10.42□□□□□ -0.74
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TRPS1-206ENST00000517323 PRR34Q9NV39 138 aa10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-206ENST00000517323 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
TRPS1-206ENST00000517323 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa10.41□□□□□ -0.74
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TRPS1-206ENST00000517323 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa10.3□□□□□ -0.76
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TRPS1-206ENST00000517323 MALP21145 153 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-206ENST00000517323 VAMP3Q15836 100 aa10.29□□□□□ -0.76
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TRPS1-206ENST00000517323 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-206ENST00000517323 HERVK_113P61574 105 aa10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHB2Q96CS7 222 aa10.28□□□□□ -0.76
TRPS1-206ENST00000517323 LEPROTO15243 131 aa10.27□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 RNF151Q2KHN1 245 aa10.27□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 COX8AP10176 69 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 C15orf56Q8N910 161 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF815PA8K554 130 aa10.26□□□□□ -0.77
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