RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 LITAFQ99732 161 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 CELA1Q9UNI1 258 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 F5H768 121 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 PAX4O43316 350 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 A6NJY4 79 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 K7EP34 96 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 DAD1P61803 113 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GUV1 79 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 GAGE10A6NGK3 116 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFA1O15239 70 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 TIMM17BO60830 172 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP5G1P05496 136 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM238C9JI98 176 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 SPANXCQ9NY87 97 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 CFC1BP0CG36 223 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 CFC1P0CG37 223 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 FABP2P12104 132 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 RBX1P62877 108 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 K7EIL1 84 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 A4D1N5 150 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A096LPF7 62 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0B4J2C4 111 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 MIAQ16674 131 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 RETNQ9HD89 108 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A087WZ39 114 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 APOMO95445 188 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 TSPAN13O95857 204 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 IFITM1P13164 125 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 Q9H8V8 135 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM262E9PQX1 116 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BNG1 76 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-33P01772 117 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 HERV-K104P63124 156 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 HTN3P15516 51 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 LELP1Q5T871 98 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 COX7B2Q8TF08 81 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS2P07478 247 aa7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 SS18Q15532 418 aa7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 C5orf38Q86SI9 138 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8N3U1 123 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 B9D2Q9BPU9 175 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 PRO0461Q9UI25 63 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 ERG28Q9UKR5 140 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 F8W1H4 67 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 XCL1P47992 114 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 REG3AQ06141 175 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZTC4 211 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 DAND5Q8N907 189 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR34Q9NV39 138 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0J9YWU9 116 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BMG7 143 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 NPC2P61916 151 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 SFTA2Q6UW10 78 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-209ENST00000504450 RYR3Q15413 4870 aa7.34□□□□□ -1.24
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.33□□□□□ -1.24
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