RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 UBE2L6O14933 153 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 TCAPO15273 167 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 BAALCQ8WXS3 180 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 BTF3L4Q96K17 158 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 PKD1P98161 4303 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 ATP6V1G1O75348 118 aa4.87□□□□□ -1.63
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UBE2B-204ENST00000504431 S100A8P05109 93 aa4.87□□□□□ -1.63
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UBE2B-204ENST00000504431 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
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UBE2B-204ENST00000504431 DSCR10P59022 87 aa4.86□□□□□ -1.63
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UBE2B-204ENST00000504431 C16orf90A8MZG2 172 aa4.85□□□□□ -1.63
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UBE2B-204ENST00000504431 RHEBQ15382 184 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 LINC01620Q4KN68 170 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 SVBPQ8N300 66 aa4.85□□□□□ -1.63
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UBE2B-204ENST00000504431 LCE1EQ5T753 118 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.84□□□□□ -1.63
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UBE2B-204ENST00000504431 C20orf78Q9BR46 151 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-204ENST00000504431 PRR34Q9NV39 138 aa4.84□□□□□ -1.63
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UBE2B-204ENST00000504431 HERV-K104P63124 156 aa4.83□□□□□ -1.64
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UBE2B-204ENST00000504431 FAM104AQ969W3 186 aa4.82□□□□□ -1.64
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UBE2B-204ENST00000504431 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-204ENST00000504431 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.82□□□□□ -1.64
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UBE2B-204ENST00000504431 YPEL4Q96NS1 127 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-204ENST00000504431 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-204ENST00000504431 PKHD1P08F94 4074 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-204ENST00000504431 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.8□□□□□ -1.64
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UBE2B-204ENST00000504431 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2B-204ENST00000504431 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.79□□□□□ -1.64
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UBE2B-204ENST00000504431 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-204ENST00000504431 SS18Q15532 418 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2B-204ENST00000504431 PMCHL1Q16048 86 aa4.78□□□□□ -1.64
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