RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TMEM18-208	ENST00000497508	GCSH	P23434	173 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM18-208	ENST00000497508	CEND1	Q8N111	149 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM18-208	ENST00000497508	TM2D2	Q9BX73	214 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM18-208	ENST00000497508	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLL5	B9A064	214 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	PAX4	O43316	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	ATP5G1	P05496	136 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H4G	Q99525	98 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508		H3BRM9	83 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	FXYD2	P54710	66 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	HERVK_113	P63121	156 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	GAGE6	Q13070	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508		Q6ZVH6	145 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A0J9YY99	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	PTTG1IP	P53801	180 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	RYR3	Q15413	4870 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	SPINK8	P0C7L1	97 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508		F5H768	121 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	SMIM13	P0DJ93	91 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	COX6A2	Q02221	97 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508		K7EP13	123 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	RYR2	Q92736	4967 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	C9orf118	A6NHY6	69 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A096LPF7	62 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	LCE6A	A0A183	80 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GUV1	79 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	VAMP3	Q15836	100 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A0J9YXY3	114 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GWB2	263 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508		A6NJY4	79 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM238	C9JI98	176 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	LY6G6C	O95867	125 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3-30	P01768	117 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB37	Q96AX2	223 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		10.02	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM262	E9PQX1	116 aa		10.02	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508		K7ERJ3	54 aa		10.02	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	RBX1	P62877	108 aa		10.02	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	UBE2V1	Q13404	147 aa		10.02	□□□□□ -0.8
TMEM18-208	ENST00000497508	NDUFA1	O15239	70 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508		H3BUT2	72 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508		H3BNG1	76 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	TIMM17B	O60830	172 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	KMT2A	Q03164	3969 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	LELP1	Q5T871	98 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	LITAF	Q99732	161 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1W2PPM0	123 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	CCL25	O15444	150 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	SPANXC	Q9NY87	97 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	SS18	Q15532	418 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		9.96	□□□□□ -0.81
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A087WZ39	114 aa		9.96	□□□□□ -0.82
TMEM18-208	ENST00000497508	FABP2	P12104	132 aa		9.96	□□□□□ -0.82
TMEM18-208	ENST00000497508	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		9.96	□□□□□ -0.82
TMEM18-208	ENST00000497508		Q9H8V8	135 aa		9.96	□□□□□ -0.82

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