RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100A6	P06703	90 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRSS1	P07477	247 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX6A2	Q02221	97 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0J9YXV3	536 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266		H7C423	109 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2D1	P51668	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTDAP	P60985	99 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A087WX48	190 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266		H0Y8G0	127 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP5L	O75964	103 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100A2	P29034	98 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYST	Q99698	3801 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIVA1	O15304	175 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL18	P55774	89 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	PMVK	Q15126	192 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZR54	194 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	RYR2	Q92736	4967 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2L6	O14933	153 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKR1D1	P51857	326 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCTA	P57738	103 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	REG3A	Q06141	175 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	WFDC2	Q14508	124 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	VCX2	Q9H322	139 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266		F8VRH5	84 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL25	O15444	150 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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