RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL6A5A8TX70 2615 aa11.17□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.17□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INSP01308 110 aa11.16□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6ZTI0 123 aa11.16□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DAND5Q8N907 189 aa11.16□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2WQ96B02 151 aa11.16□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC01620Q4KN68 170 aa11.16□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFA7O95182 113 aa11.15□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PF4P02776 101 aa11.15□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa11.15□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2orf82Q6UX34 121 aa11.15□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.15□□□□□ -0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM104AQ969W3 186 aa11.14□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM101Q96IK0 257 aa11.14□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0J9YXY3 114 aa11.13□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.13□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BAHCC1Q9P281 2608 aa11.13□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.13□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.12□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 J3KT08 172 aa11.11□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGHV3-33P01772 117 aa11.11□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.11□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATXN8Q156A1 80 aa11.11□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.11□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFB4AO15263 64 aa11.1□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C16orf95Q9H693 158 aa11.1□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.1□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa11.1□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.1□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.09□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.09□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGLV1-51P01701 117 aa11.09□□□□□ -0.63
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.08□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A8MTW9 85 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC2BQ92478 149 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C4orf26Q17RF5 130 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RS1O15537 224 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIAP1O43715 76 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COX6A2Q02221 97 aa11.07□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F5H768 121 aa11.06□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAGE2AQ6NT46 116 aa11.06□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.06□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H7C423 109 aa11.06□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.06□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.06□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 hADV29S1A0JD25 119 aa11.05□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TENM3Q9P273 2699 aa11.05□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFB130BP0DP73 79 aa11.05□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFB130AP0DP74 79 aa11.05□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANK2Q01484 3957 aa11.04□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.04□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYSTM1Q9H1C7 97 aa11.04□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LITAFQ99732 161 aa11.03□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa11.03□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UQCRQO14949 82 aa11.03□□□□□ -0.64
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A096LPF7 62 aa11.01□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DSCR8Q96T75 97 aa11.01□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.01□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q9H8V8 135 aa11.01□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.01□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0B4J2C4 111 aa11□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00526Q96FQ7 95 aa11□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMCR5Q8TEV8 140 aa11□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 K7EQD1 137 aa10.98□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIAQ16674 131 aa10.98□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.98□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WIPF1O43516 503 aa10.98□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFB135Q30KP9 77 aa10.98□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa10.97□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.97□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2L6O14933 153 aa10.97□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.96□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOMM7Q9P0U1 55 aa10.96□□□□□ -0.65
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OXTP01178 125 aa10.96□□□□□ -0.66
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRIMA1Q86XR5 153 aa10.95□□□□□ -0.66
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa10.95□□□□□ -0.66
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10.95□□□□□ -0.66
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1B0GX51 115 aa10.94□□□□□ -0.66
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COX7CP15954 63 aa10.94□□□□□ -0.66
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa10.94□□□□□ -0.66
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL17DQ8TAD2 202 aa10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 171.9 ms