RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 SCXQ7RTU7 201 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-210ENST00000488157 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-210ENST00000488157 TOMM6Q96B49 74 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-210ENST00000488157 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
NISCH-210ENST00000488157 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.78□□□□□ -1.16
NISCH-210ENST00000488157 MALP21145 153 aa7.78□□□□□ -1.16
NISCH-210ENST00000488157 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.78□□□□□ -1.16
NISCH-210ENST00000488157 FA2HQ7L5A8 372 aa7.78□□□□□ -1.16
NISCH-210ENST00000488157 AMELXQ99217 191 aa7.78□□□□□ -1.16
NISCH-210ENST00000488157 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
NISCH-210ENST00000488157 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 CHTF8P0CG12 524 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 UBE2D1P51668 147 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 VCX2Q9H322 139 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.76□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 A0A096LNJ9 63 aa7.76□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 PMCHL1Q16048 86 aa7.76□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.76□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.75□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 LINC00614P0C842 121 aa7.75□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 Q5VSD8 79 aa7.75□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 Q6ZN92 141 aa7.75□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 ERASQ7Z444 233 aa7.75□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 TIMM17AQ99595 171 aa7.75□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 EPM2AB3EWF7 344 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 SYCNQ0VAF6 134 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 Q6ZRU5 148 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 FAT1Q14517 4588 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 A0A087WZ39 114 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 A0A0J9YXV3 536 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 COLCA2A8K830 154 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 TRGC2P03986 189 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 NPSP0C0P6 89 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 G0S2P27469 103 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 SPAG11BQ08648 103 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 CARD19Q96LW7 228 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 APOMO95445 188 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.71□□□□□ -1.17
NISCH-210ENST00000488157 A0A096LNI7 61 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 KIAA0087Q14695 138 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 C10orf25Q5T742 122 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 A0A087WYN8 130 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 DPH3Q96FX2 82 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 C2orf48Q96LS8 159 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 CST9LQ9H4G1 147 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 FAM229AH3BQW9 127 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 HBDP02042 147 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 RAB5BP61020 215 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 MAJINQ3KP22 176 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 LINC01549A6NIU2 74 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 NDUFA6P56556 154 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 PMVKQ15126 192 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 C2orf82Q6UX34 121 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 LINC00310P59036 64 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 HERVK_113P63121 156 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 GAGE2BQ13066 116 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 NUPR1O60356 82 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 BAGE3Q86Y29 109 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 STPG4Q8N801 248 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 NDUFA1O15239 70 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 PTTG1IPP53801 180 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 SEC11AP67812 179 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-210ENST00000488157 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-210ENST00000488157 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-210ENST00000488157 SERF1AO75920 110 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-210ENST00000488157 S100A6P06703 90 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-210ENST00000488157 SPINK8P0C7L1 97 aa7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.8 ms