RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 hDV102S1A0JD36 115 aa8.35□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 IFITM10A6NMD0 228 aa8.35□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 SLPIP03973 132 aa8.35□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 NPSP0C0P6 89 aa8.35□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 Q6ZSA8 131 aa8.35□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 AMELXQ99217 191 aa8.35□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 TIMM17AQ99595 171 aa8.35□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 COLCA2A8K830 154 aa8.34□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.34□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 FA2HQ7L5A8 372 aa8.34□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.34□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.33□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.33□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 SCO1O75880 301 aa8.33□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 G0S2P27469 103 aa8.33□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 UBE2D1P51668 147 aa8.33□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.33□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.33□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 CFAP161Q6P656 301 aa8.33□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.33□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.33□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.33□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 ERASQ7Z444 233 aa8.32□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.31□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 LINC01549A6NIU2 74 aa8.31□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 COX7A2LO14548 114 aa8.31□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 TRGC2P03986 189 aa8.31□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 LINC00614P0C842 121 aa8.31□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 Q6ZN92 141 aa8.31□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.31□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 C5orf38Q86SI9 138 aa8.31□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 COX6A2Q02221 97 aa8.3□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.3□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.3□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.3□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 VCX2Q9H322 139 aa8.3□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 PMCHL1Q16048 86 aa8.29□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.29□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 HBDP02042 147 aa8.28□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 LINC00310P59036 64 aa8.28□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 RAB5BP61020 215 aa8.28□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.28□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.28□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 RNF213Q63HN8 5207 aa8.27□□□□□ -1.08
SSR4-211ENST00000486204 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.27□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 A0A087WZ39 114 aa8.27□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 MALP21145 153 aa8.27□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.26□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 PANO1I0J062 215 aa8.26□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 APOMO95445 188 aa8.26□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 OXTP01178 125 aa8.26□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.26□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 A0A0J9YXV3 536 aa8.25□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.25□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 SPAG11BQ08648 103 aa8.25□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 PMVKQ15126 192 aa8.25□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 SCXQ7RTU7 201 aa8.25□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.25□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.25□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 CST9LQ9H4G1 147 aa8.25□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 HERVK_113P63121 156 aa8.24□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 SYCNQ0VAF6 134 aa8.24□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 KIAA0087Q14695 138 aa8.24□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 Q6ZRU5 148 aa8.24□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.24□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 C2orf48Q96LS8 159 aa8.24□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 CARD19Q96LW7 228 aa8.24□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.24□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.24□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.23□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 ATP6V1G1O75348 118 aa8.23□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 SEC11AP67812 179 aa8.23□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 BAGE3Q86Y29 109 aa8.23□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.23□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.22□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 SERF1AO75920 110 aa8.22□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 CHTF8P0CG12 524 aa8.22□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.22□□□□□ -1.09
SSR4-211ENST00000486204 NUPR1O60356 82 aa8.21□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 HSBP1O75506 76 aa8.21□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 ATP5LO75964 103 aa8.21□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.21□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.21□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 A0A096LNI7 61 aa8.2□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 HIST1H2BKO60814 126 aa8.2□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 HIST1H2BJP06899 126 aa8.2□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 IGLC3P0DOY3 106 aa8.2□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 S100A1P23297 94 aa8.2□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 HIST1H2BOP23527 126 aa8.2□□□□□ -1.1
SSR4-211ENST00000486204 HIST1H2BBP33778 126 aa8.2□□□□□ -1.1
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