RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484893.1

GINS1-204, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GINS1, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-204ENST00000484893 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-204ENST00000484893 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS1-204ENST00000484893 VCX2Q9H322 139 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS1-204ENST00000484893 CST9LQ9H4G1 147 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS1-204ENST00000484893 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-204ENST00000484893 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-204ENST00000484893 EREGO14944 169 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 C5orf38Q86SI9 138 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 KRTAP10-1P60331 282 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 Q6ZN92 141 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 A0A087WZ39 114 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 A0A0J9YXV3 536 aa8.44□□□□□ -1.06
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GINS1-204ENST00000484893 PMVKQ15126 192 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.43□□□□□ -1.06
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GINS1-204ENST00000484893 ATP5LO75964 103 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 C14orf177Q52M58 125 aa8.43□□□□□ -1.06
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GINS1-204ENST00000484893 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 C16orf90A8MZG2 172 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 LINC01620Q4KN68 170 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.42□□□□□ -1.06
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GINS1-204ENST00000484893 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.41□□□□□ -1.06
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GINS1-204ENST00000484893 hDV102S1A0JD36 115 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 IGLC3P0DOY3 106 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 KIAA0087Q14695 138 aa8.41□□□□□ -1.06
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GINS1-204ENST00000484893 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS1-204ENST00000484893 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 GCSHP23434 173 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 NDUFA6P56556 154 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 HERVK_113P63121 156 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.39□□□□□ -1.07
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GINS1-204ENST00000484893 HSPG2P98160 4391 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 C2orf48Q96LS8 159 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
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GINS1-204ENST00000484893 APOMO95445 188 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 XGP55808 180 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 SPAG11BQ08648 103 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 C10orf25Q5T742 122 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 Q6ZRU5 148 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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GINS1-204ENST00000484893 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS1-204ENST00000484893 F8VRH5 84 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS1-204ENST00000484893 SPINK8P0C7L1 97 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS1-204ENST00000484893 C2orf82Q6UX34 121 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS1-204ENST00000484893 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.33□□□□□ -1.08
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GINS1-204ENST00000484893 Q8IZM0 81 aa8.32□□□□□ -1.08
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GINS1-204ENST00000484893 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS1-204ENST00000484893 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-204ENST00000484893 F8WDY8 70 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-204ENST00000484893 RNF151Q2KHN1 245 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-204ENST00000484893 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-204ENST00000484893 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-204ENST00000484893 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-204ENST00000484893 TMEM223A0PJW6 202 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-204ENST00000484893 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.3□□□□□ -1.08
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