RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 ETDBQ3ZM63 59 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM262E9PQX1 116 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 H3BNG1 76 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 APOMO95445 188 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 ODF3Q96PU9 254 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A096LPF7 62 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 H3BVH4 76 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 J3KRW8 73 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 PMVKQ15126 192 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 TEN1Q86WV5 123 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 IGIPA6NJ69 53 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF815PA8K554 130 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6ZTI0 123 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 NFE4Q86UQ8 179 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 VCYO14598 125 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 CRYBA4P53673 196 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP10-1P60331 282 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 KLLNB2CW77 178 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 TSPAN13O95857 204 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 CRYGDP07320 174 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 RHOHQ15669 191 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 MDFICQ9P1T7 246 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF876PQ49A33 203 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 PRR9Q5T870 116 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 KIR2DL4Q99706 377 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 CDIP1Q9H305 208 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A0B4J2C4 111 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV3-30P01768 117 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 SVIPQ8NHG7 77 aa8□□□□□ -1.13
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RABGEF1-207ENST00000484547 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.99□□□□□ -1.13
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RABGEF1-207ENST00000484547 HAMPP81172 84 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 A8MWV9 139 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 LEPROTO15243 131 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 PAX4O43316 350 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 TSHBP01222 138 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6ZUT4 128 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 SYT8Q8NBV8 401 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 AMELXQ99217 191 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV3-53P01767 116 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6Q795 121 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-207ENST00000484547 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.97□□□□□ -1.13
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RABGEF1-207ENST00000484547 CFC1P0CG37 223 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 C9orf85Q96MD7 179 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 J3QL48 77 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 J3QQQ9 107 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6ZSN1 163 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM223A0PJW6 202 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 TCL1BO95988 128 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 MGPP08493 103 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 SPINK8P0C7L1 97 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.94□□□□□ -1.14
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