RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483062.5

SYN3-212, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 3

Gene SYN3, Length 827 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-212ENST00000483062 TM2D2Q9BX73 214 aa5.16□□□□□ -1.58
SYN3-212ENST00000483062 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.16□□□□□ -1.58
SYN3-212ENST00000483062 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.15□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 IGHV3-30P01768 117 aa5.15□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 IGHV3-33P01772 117 aa5.15□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.15□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.15□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 RBX1P62877 108 aa5.15□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 Q6ZN92 141 aa5.15□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 Q9HAA7 133 aa5.15□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HSBP1O75506 76 aa5.14□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 WFDC2Q14508 124 aa5.14□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 MIAQ16674 131 aa5.14□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.14□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 TMEM141Q96I45 108 aa5.14□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 TIMM17AQ99595 171 aa5.14□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.14□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 ATP5LO75964 103 aa5.13□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HBDP02042 147 aa5.13□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 MPV17L2Q567V2 206 aa5.13□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 ERASQ7Z444 233 aa5.13□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.13□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 TOMM6Q96B49 74 aa5.13□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.13□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 VCX2Q9H322 139 aa5.13□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 KLK12Q9UKR0 248 aa5.13□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.13□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 S100A6P06703 90 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 SEC11AP67812 179 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 REG3AQ06141 175 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 SS18Q15532 418 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 Q8N976 141 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 UBE2WQ96B02 151 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 PRR34Q9NV39 138 aa5.12□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HIST1H2BKO60814 126 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HIST1H2BJP06899 126 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HIST1H2BOP23527 126 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HIST1H2BBP33778 126 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HIST1H2BDP58876 126 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HIST1H2BCP62807 126 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.11□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 IGIPA6NJ69 53 aa5.1□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.1□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 MUC2Q02817 5179 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 IFITM10A6NMD0 228 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 LECT2O14960 151 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 SERF1AO75920 110 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 LEPROTL1O95214 131 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 NDUFA6P56556 154 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 LINC00310P59036 64 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 LINC01620Q4KN68 170 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 C14orf177Q52M58 125 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 CFAP161Q6P656 301 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 ENHOQ6UWT2 76 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 BAALCQ8WXS3 180 aa5.09□□□□□ -1.59
SYN3-212ENST00000483062 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 PRSS1P07477 247 aa5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 AKR1D1P51857 326 aa5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 PMVKQ15126 192 aa5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 AMELXQ99217 191 aa5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 LPAP08519 4548 aa5.08□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 APOMO95445 188 aa5.07□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 S100A2P29034 98 aa5.07□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 HERVK_113P63121 156 aa5.07□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.07□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 Q6ZRU5 148 aa5.07□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 Q6ZUT4 128 aa5.07□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SYN3-212ENST00000483062 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.07□□□□□ -1.6
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