RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482928.5

TSPAN1-208, Transcript of tetraspanin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN1, Length 844 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1-208ENST00000482928 NMUP48645 174 aa8.54□□□□□ -1.04
TSPAN1-208ENST00000482928 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.54□□□□□ -1.04
TSPAN1-208ENST00000482928 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.54□□□□□ -1.04
TSPAN1-208ENST00000482928 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.54□□□□□ -1.04
TSPAN1-208ENST00000482928 FAM104AQ969W3 186 aa8.54□□□□□ -1.04
TSPAN1-208ENST00000482928 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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TSPAN1-208ENST00000482928 CCL25O15444 150 aa8.53□□□□□ -1.04
TSPAN1-208ENST00000482928 REG3AQ06141 175 aa8.53□□□□□ -1.04
TSPAN1-208ENST00000482928 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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TSPAN1-208ENST00000482928 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.51□□□□□ -1.05
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TSPAN1-208ENST00000482928 C14orf144Q96I85 54 aa8.5□□□□□ -1.05
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TSPAN1-208ENST00000482928 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TSPAN1-208ENST00000482928 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.48□□□□□ -1.05
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TSPAN1-208ENST00000482928 LEPROTO15243 131 aa8.47□□□□□ -1.05
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TSPAN1-208ENST00000482928 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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TSPAN1-208ENST00000482928 ZNF815PA8K554 130 aa8.45□□□□□ -1.06
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TSPAN1-208ENST00000482928 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.43□□□□□ -1.06
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TSPAN1-208ENST00000482928 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.42□□□□□ -1.06
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TSPAN1-208ENST00000482928 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.39□□□□□ -1.07
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TSPAN1-208ENST00000482928 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.39□□□□□ -1.07
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TSPAN1-208ENST00000482928 CKS1BP61024 79 aa8.38□□□□□ -1.07
TSPAN1-208ENST00000482928 SFTA2Q6UW10 78 aa8.38□□□□□ -1.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TM2D2Q9BX73 214 aa8.38□□□□□ -1.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.38□□□□□ -1.07
TSPAN1-208ENST00000482928 COX11Q9Y6N1 276 aa8.38□□□□□ -1.07
TSPAN1-208ENST00000482928 NDUFA1O15239 70 aa8.37□□□□□ -1.07
TSPAN1-208ENST00000482928 HERV-K104P63124 156 aa8.37□□□□□ -1.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CTAG1AP78358 180 aa8.37□□□□□ -1.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
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