RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP1-206ENST00000469947 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP1-206ENST00000469947 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP1-206ENST00000469947 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP1-206ENST00000469947 J3KT08 172 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP1-206ENST00000469947 MALP21145 153 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP1-206ENST00000469947 F5H768 121 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 hADV29S1A0JD25 119 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 ATOX1O00244 68 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 CRPP02741 224 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 JMJD1CQ15652 2540 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A087WVE0 104 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 A8MTW9 85 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS28P62857 69 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 FBN2P35556 2912 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAL4O96015 105 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF843Q8N446 348 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 CHD6Q8TD26 2715 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV2D-28P01615 120 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 INSP01308 110 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 SLPIP03973 132 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 PF4P02776 101 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 C5orf47Q569G3 176 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZTI0 123 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 B4DSR2 109 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 F8WDY8 70 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00158P58513 81 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00846Q9NV44 126 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 NCR3O14931 201 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.59□□□□□ -0.87
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SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF702PQ9H963 129 aa9.59□□□□□ -0.87
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SH3BP1-206ENST00000469947 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 COX7B2Q8TF08 81 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 UPK3BQ9BT76 320 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.57□□□□□ -0.88
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SH3BP1-206ENST00000469947 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 CCL18P55774 89 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 PTPN13Q12923 2485 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 TENM4Q6N022 2769 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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SH3BP1-206ENST00000469947 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 PAX4O43316 350 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 DPH3Q96FX2 82 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.52□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 PLA2G2AP14555 144 aa9.52□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.52□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 STHQ8IWL8 128 aa9.52□□□□□ -0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 DSCR8Q96T75 97 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 H0YGX0 51 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 HILS1P60008 231 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 NF1P21359 2839 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PRX2 142 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 USP17L23D6RBM5 183 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 OXTP01178 125 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.5□□□□□ -0.89
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