RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468599.1

CNOT10-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT10, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-211ENST00000468599 TIMM17AQ99595 171 aa7.36□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.35□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 CDK2AP2O75956 126 aa7.35□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 LINC01620Q4KN68 170 aa7.35□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.35□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 SLPIP03973 132 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 UBE2D1P51668 147 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 COX6A2Q02221 97 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 ERASQ7Z444 233 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.34□□□□□ -1.23
CNOT10-211ENST00000468599 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.33□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HBDP02042 147 aa7.33□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 NPSP0C0P6 89 aa7.33□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 S100A1P23297 94 aa7.33□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.33□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.33□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 C5orf38Q86SI9 138 aa7.33□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 hDV102S1A0JD36 115 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 NUPR1O60356 82 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 SERF1AO75920 110 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 C14orf177Q52M58 125 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 Q6ZN92 141 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.32□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 COX7A2LO14548 114 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 GCSHP23434 173 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 G0S2P27469 103 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 RAB5BP61020 215 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 BAGE3Q86Y29 109 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 VCX2Q9H322 139 aa7.31□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HIST1H2BKO60814 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HIST1H2BJP06899 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HIST1H2BOP23527 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HIST1H2BBP33778 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HIST1H2BDP58876 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HIST1H2BCP62807 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 Q8N1X5 172 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.3□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 A0A0J9YXV3 536 aa7.29□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 LINC01549A6NIU2 74 aa7.29□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HAMPP81172 84 aa7.29□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 CST9LQ9H4G1 147 aa7.29□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 HSBP1O75506 76 aa7.28□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 PMVKQ15126 192 aa7.28□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.28□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 Q6ZSA8 131 aa7.28□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.28□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CNOT10-211ENST00000468599 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 A0A087WZ39 114 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 MALP21145 153 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 XGP55808 180 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 SPAG11BQ08648 103 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 CFAP161Q6P656 301 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.27□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 PANO1I0J062 215 aa7.26□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 ATP5LO75964 103 aa7.26□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.25□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.25□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 IGLC3P0DOY3 106 aa7.25□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 HERVK_113P63121 156 aa7.25□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 KIAA0087Q14695 138 aa7.25□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 Q6ZRU5 148 aa7.25□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.25□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 APOMO95445 188 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 NDUFA6P56556 154 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 CARD19Q96LW7 228 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.24□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 C11orf86A6NJI1 115 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 CHTF8P0CG12 524 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 C10orf25Q5T742 122 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.23□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CNOT10-211ENST00000468599 LEPROTL1O95214 131 aa7.22□□□□□ -1.25
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