RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1B0GUV1 79 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 K7EP13 123 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 SMIM6P0DI80 62 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 A0A087WX48 190 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 PKIAP61925 76 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 RBX1P62877 108 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 LINC01545Q5VT33 79 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 FAM104AQ969W3 186 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM243Q9BU79 118 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM262E9PQX1 116 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 EREGO14944 169 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 PYY3Q5JQD4 70 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 AMELXQ99217 191 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 CRPP02741 224 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 PRSS1P07477 247 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 GCSHP23434 173 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 KRTDAPP60985 99 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 PMVKQ15126 192 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZN92 141 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 Q8N1X5 172 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 CCL25O15444 150 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 FGF6P10767 208 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 Q5VSD8 79 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 VCX2Q9H322 139 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 CST9LQ9H4G1 147 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 C20orf202A1L168 122 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 ODF1Q14990 250 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 PRR34Q9NV39 138 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 USP17L23D6RBM5 183 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 F8VRH5 84 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 UBE2L6O14933 153 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 SCGB1D1O95968 90 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM101Q96IK0 257 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 TM2D2Q9BX73 214 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 TNXBP22105 4242 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 SEC11AP67812 179 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZSA8 131 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 LCE2BO14633 110 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 DPM2O94777 84 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 PLNP26678 52 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 REG3AQ06141 175 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 RMI2Q96E14 147 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-216ENST00000428482 PANO1I0J062 215 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 IGLC3P0DOY3 106 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 MIAQ16674 131 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 SCXQ7RTU7 201 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 IGKCP01834 107 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 UBE2D1P51668 147 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 C15orf56Q8N910 161 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 EPM2AB3EWF7 344 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZUT4 128 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 C11orf86A6NJI1 115 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 HERVK_113P63121 156 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 COX11Q9Y6N1 276 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00587B1AMM8 73 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85 ms