RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 FOXI1Q12951 378 aa9.66□□□□□ -0.86
CITED1-204ENST00000427412 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.66□□□□□ -0.86
CITED1-204ENST00000427412 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.66□□□□□ -0.86
CITED1-204ENST00000427412 TMEM141Q96I45 108 aa9.66□□□□□ -0.86
CITED1-204ENST00000427412 PRSS1P07477 247 aa9.65□□□□□ -0.86
CITED1-204ENST00000427412 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CITED1-204ENST00000427412 Q6ZN92 141 aa9.65□□□□□ -0.86
CITED1-204ENST00000427412 FAM104AQ969W3 186 aa9.65□□□□□ -0.86
CITED1-204ENST00000427412 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.65□□□□□ -0.86
CITED1-204ENST00000427412 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.64□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.64□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 C15orf56Q8N910 161 aa9.64□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.64□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 TRGC2P03986 189 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 MALP21145 153 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 PMCHL1Q16048 86 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 TOMM6Q96B49 74 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 G0S2P27469 103 aa9.62□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 CFAP161Q6P656 301 aa9.62□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 C5orf38Q86SI9 138 aa9.62□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.62□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 COX7A2LO14548 114 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 VCX2Q9H322 139 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 LINC01546A6NGU7 62 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 IGIPA6NJ69 53 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 COLCA2A8K830 154 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 LINC00614P0C842 121 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 TIMM17AQ99595 171 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 RAB5BP61020 215 aa9.59□□□□□ -0.87
CITED1-204ENST00000427412 ATP6V1G1O75348 118 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 HBDP02042 147 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 UBE2D1P51668 147 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 ERASQ7Z444 233 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 BAGE3Q86Y29 109 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 AMELXQ99217 191 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 A0A096LNJ9 63 aa9.57□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.57□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 NDUFA6P56556 154 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 COX6A2Q02221 97 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 LINC01549A6NIU2 74 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 APOMO95445 188 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 NPSP0C0P6 89 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 SPAG11BQ08648 103 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 TNXBP22105 4242 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 A0A0J9YXV3 536 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 SLPIP03973 132 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 LRP2P98164 4655 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 HSBP1O75506 76 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 MT1HL1P0DM35 61 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 CARD19Q96LW7 228 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CITED1-204ENST00000427412 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.52□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 SERF1AO75920 110 aa9.52□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 PMVKQ15126 192 aa9.52□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.52□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.52□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 S100A1P23297 94 aa9.51□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 HERVK_113P63121 156 aa9.51□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.51□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.51□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 A0A087WZ39 114 aa9.5□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 ATP5LO75964 103 aa9.5□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 SEC11AP67812 179 aa9.5□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 SYCNQ0VAF6 134 aa9.5□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 CST9LQ9H4G1 147 aa9.5□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.5□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 CHTF8P0CG12 524 aa9.49□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 LINC00310P59036 64 aa9.49□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 Q6ZRU5 148 aa9.49□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.49□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.49□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.48□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 H0Y8G0 127 aa9.48□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.47□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 PANO1I0J062 215 aa9.47□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 PRSS2P07478 247 aa9.47□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CITED1-204ENST00000427412 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms