RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424636.2

TRDMT1-204, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRDMT1, Length 333 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-204ENST00000424636 ALX1Q15699 326 aa-0.98□□□□□ -2.57
TRDMT1-204ENST00000424636 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.98□□□□□ -2.57
TRDMT1-204ENST00000424636 Q6AWC8 147 aa-0.98□□□□□ -2.57
TRDMT1-204ENST00000424636 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.98□□□□□ -2.57
TRDMT1-204ENST00000424636 SEC11CQ9BY50 192 aa-0.98□□□□□ -2.57
TRDMT1-204ENST00000424636 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.98□□□□□ -2.57
TRDMT1-204ENST00000424636 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.98□□□□□ -2.57
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TRDMT1-204ENST00000424636 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-1□□□□□ -2.57
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TRDMT1-204ENST00000424636 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-1.01□□□□□ -2.57
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TRDMT1-204ENST00000424636 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-1.01□□□□□ -2.57
TRDMT1-204ENST00000424636 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-1.01□□□□□ -2.57
TRDMT1-204ENST00000424636 MYOM1P52179 1685 aa-1.01□□□□□ -2.57
TRDMT1-204ENST00000424636 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-1.01□□□□□ -2.57
TRDMT1-204ENST00000424636 TCHHQ07283 1943 aa-1.01□□□□□ -2.57
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TRDMT1-204ENST00000424636 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-1.02□□□□□ -2.57
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TRDMT1-204ENST00000424636 A0A0G2JMZ2 1700 aa-1.03□□□□□ -2.57
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TRDMT1-204ENST00000424636 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-1.03□□□□□ -2.57
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TRDMT1-204ENST00000424636 F8VRH5 84 aa-1.03□□□□□ -2.57
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TRDMT1-204ENST00000424636 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-1.03□□□□□ -2.57
TRDMT1-204ENST00000424636 C10orf128Q5T292 105 aa-1.03□□□□□ -2.57
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TRDMT1-204ENST00000424636 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-1.04□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 TSPAN19P0C672 248 aa-1.04□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 SCGB1A1P11684 91 aa-1.04□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-1.04□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 C10orf113Q5VZT2 155 aa-1.04□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 TAC4Q86UU9 113 aa-1.04□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 KCNRGQ8N5I3 272 aa-1.04□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 TET3O43151 1660 aa-1.04□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 SHROOM2Q13796 1616 aa-1.04□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 FRYQ5TBA9 3013 aa-1.05□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-1.05□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-1.05□□□□□ -2.58
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TRDMT1-204ENST00000424636 MT1HP80294 61 aa-1.05□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 TTC9CQ8N5M4 171 aa-1.05□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 ANKRD36A6QL64 1941 aa-1.05□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 TRIOO75962 3097 aa-1.05□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 COL12A1Q99715 3063 aa-1.06□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 ARPC5O15511 151 aa-1.06□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 SFT2D2O95562 160 aa-1.06□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
TRDMT1-204ENST00000424636 LZICQ8WZA0 190 aa-1.06□□□□□ -2.58
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