RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTBP8-201ENST00000403258 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTBP8-201ENST00000403258 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTBP8-201ENST00000403258 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTBP8-201ENST00000403258 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 SERF1AO75920 110 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 PMVKQ15126 192 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.96□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 hDV102S1A0JD36 115 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 MALP21145 153 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 APOMO95445 188 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 HERVK_113P63121 156 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 CST9LQ9H4G1 147 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A087WZ39 114 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 GCSHP23434 173 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 C5orf38Q86SI9 138 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 PKD1P98161 4303 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 COX6A2Q02221 97 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.92□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.91□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A0J9YXV3 536 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 NUPR1O60356 82 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 LEPROTL1O95214 131 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.9□□□□□ -0.82
ACTBP8-201ENST00000403258 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 IGLC3P0DOY3 106 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 SLPIP03973 132 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 NDUFA6P56556 154 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 KRTAP10-1P60331 282 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 F8WDY8 70 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 SPAG11BQ08648 103 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 C2orf48Q96LS8 159 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 CDK2AP2O75956 126 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 CARD19Q96LW7 228 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 H3BRM9 83 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 SYCNQ0VAF6 134 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 KIAA0087Q14695 138 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 LINC01620Q4KN68 170 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 Q6ZSA8 131 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ACTBP8-201ENST00000403258 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 F8VRH5 84 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 Q8IZM0 81 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.83□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 NDUFA1O15239 70 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 FABP4P15090 132 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 Q6ZRU5 148 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 C11orf86A6NJI1 115 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 ODF1Q14990 250 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 RNF151Q2KHN1 245 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 PKHD1P08F94 4074 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 PRSS2P07478 247 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 CXCL5P42830 114 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 H0Y8G0 127 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 SPINK8P0C7L1 97 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP8-201ENST00000403258 XGP55808 180 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP8-201ENST00000403258 COX7B2Q8TF08 81 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP8-201ENST00000403258 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTBP8-201ENST00000403258 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTBP8-201ENST00000403258 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTBP8-201ENST00000403258 PLNP26678 52 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTBP8-201ENST00000403258 CKS1BP61024 79 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTBP8-201ENST00000403258 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTBP8-201ENST00000403258 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM223A0PJW6 202 aa9.75□□□□□ -0.85
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