RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 PRR15LQ9BU68 103 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 CRYGAP11844 174 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 ACACBO00763 2458 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 COX6A2Q02221 97 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 Q8N814 137 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 LMO4P61968 165 aa7.15□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 IGKV2D-28P01615 120 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 Q8N6K4 173 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 ZNF843Q8N446 348 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 AMELXQ99217 191 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 CACNA1AO00555 2505 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 F8W735 103 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 PRORYQ9H606 182 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 LINC00208Q96KT6 92 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 TTC28Q96AY4 2481 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 ESRGQ1W209 222 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 CASC2Q6XLA1 102 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZVQ6 151 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 Q8IZM0 81 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-202ENST00000402738 M0R378 163 aa7.09□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.09□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 EDN2P20800 178 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 Q8N9L7 120 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 B9D2Q9BPU9 175 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 LINC01546A6NGU7 62 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 COX17Q14061 63 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 Q8NA96 180 aa7.07□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.07□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.07□□□□□ -1.28
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HERC3-202ENST00000402738 SYCNQ0VAF6 134 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 Q8N2B8 174 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 FHL3Q13643 280 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 A0A087WZ39 114 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 LINC00575Q6W349 94 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 A8MTW9 85 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZSN1 163 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 DSCAMO60469 2012 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
HERC3-202ENST00000402738 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 C1orf137Q5JT78 98 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 IGLV1-40P01703 118 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 MUC7Q8TAX7 377 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 Q6YL49 198 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 LINC00482Q8N8I6 264 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 CUL9Q8IWT3 2517 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 HIVEP2P31629 2446 aa6.99□□□□□ -1.29
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