RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00614P0C842 121 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERASQ7Z444 233 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 hDV102S1A0JD36 115 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP10-1P60331 282 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C15orf56Q8N910 161 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMELXQ99217 191 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VCX2Q9H322 139 aa9.97□□□□□ -0.81
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MALP21145 153 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RYR1P21817 5038 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HERC2O95714 4834 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COLCA2A8K830 154 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APOMO95445 188 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2D1P51668 147 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEC11AP67812 179 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRGC2P03986 189 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HBDP02042 147 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZSA8 131 aa9.91□□□□□ -0.82
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.91□□□□□ -0.82
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.9□□□□□ -0.82
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 F8WDY8 70 aa9.89□□□□□ -0.83
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 HERVK_113P63121 156 aa9.89□□□□□ -0.83
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2orf48Q96LS8 159 aa9.88□□□□□ -0.83
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.87□□□□□ -0.83
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.86□□□□□ -0.83
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPAG11BQ08648 103 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CARD19Q96LW7 228 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPG2P98160 4391 aa9.85□□□□□ -0.83
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PMCHL1Q16048 86 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0J9YXV3 536 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF151Q2KHN1 245 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8N1X5 172 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.82□□□□□ -0.84
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERF1AO75920 110 aa9.81□□□□□ -0.84
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFA1O15239 70 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP6V1G1O75348 118 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLC3P0DOY3 106 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFA6P56556 154 aa9.8□□□□□ -0.84
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZRU5 148 aa9.8□□□□□ -0.84
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BRM9 83 aa9.79□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS2P07478 247 aa9.79□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8IZM0 81 aa9.79□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.79□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H2BKO60814 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H2BJP06899 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H2BOP23527 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H2BBP33778 126 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H2BDP58876 126 aa9.78□□□□□ -0.84
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