RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 SYCNQ0VAF6 134 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 SDIM1Q6ZPB5 146 aa12.52□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2D3P61077 147 aa12.52□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2D2P62837 147 aa12.52□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 CLUHP3Q96NS8 147 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 TIMM17BO60830 172 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 BPY2O14599 106 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 PCNTO95613 3336 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 C14orf177Q52M58 125 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 H0Y9J4 135 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 PLA2G2AP14555 144 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 SCXQ7RTU7 201 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF183Q96D59 192 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00242Q5T6M2 205 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 UPK3BQ9BT76 320 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 LELP1Q5T871 98 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A087WZ39 114 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 WFDC9Q8NEX5 89 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 B9D2Q9BPU9 175 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV2D-28P01615 120 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A096LNJ9 63 aa12.46□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 COX8CQ7Z4L0 72 aa12.46□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.46□□□□□ -0.41
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV10A0A0B4J240 114 aa12.46□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.46□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZQY7 126 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 IL17DQ8TAD2 202 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 LST1O00453 97 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV1-51P01701 117 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 C4orf48Q5BLP8 95 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 C5orf47Q569G3 176 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 SMIM11BQ8TCY0 68 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 ENHOQ6UWT2 76 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 C20orf197Q8N268 126 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00694P0DN24 101 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 BRI3O95415 125 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 CCKP06307 115 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 AGRNO00468 2067 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 CHCHD7Q9BUK0 85 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF580Q9UK33 172 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP4-202ENST00000392011 CYSRT1A8MQ03 144 aa12.4□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.4□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 COX6A2Q02221 97 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTS20P59510 1910 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0J9YWU9 116 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 LRCOL1A6NCL2 159 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 J3KT08 172 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZSN1 163 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 Q8IZM0 81 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 C3orf84H3BNL1 204 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 RETNQ9HD89 108 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 M0R378 163 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 M0R2N4 97 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 MUC4Q99102 2169 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL37AP8A6NKH3 93 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 FHL2Q14192 279 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 UQCRQO14949 82 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-202ENST00000392011 XGP55808 180 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 AMELXQ99217 191 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR3P79522 188 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 COX17Q14061 63 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 BEAN1Q3B7T3 259 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 F8P00451 2351 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV4-1P06312 121 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 USP24Q9UPU5 2620 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZTC4 211 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.27□□□□□ -0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L23D6RBM5 183 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 C16orf95Q9H693 158 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 WFDC10BQ8IUB3 73 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa12.26□□□□□ -0.45
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