RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390364.3

TRBV10-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 10-1(gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV10-1, Length 412 nt, Biotype TR V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-1-201ENST00000390364 CELA1Q9UNI1 258 aa6.3□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 A0A096LPF7 62 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 A0A0J9YXY3 114 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 H3BUT2 72 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 NDUFA1O15239 70 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 TIMM17BO60830 172 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 PRSS2P07478 247 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 RBX1P62877 108 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 COX6A2Q02221 97 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 LELP1Q5T871 98 aa6.29□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 IGHV3-30P01768 117 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 IFITM1P13164 125 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.28□□□□□ -1.4
TRBV10-1-201ENST00000390364 JMJD1CQ15652 2540 aa6.27□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.27□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.27□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 A0A1B0GWB2 263 aa6.27□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.27□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 ATRQ13535 2644 aa6.27□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 A0A087WZ39 114 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 A0A1W2PPM0 123 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 COX7B2Q8TF08 81 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 Q9H8V8 135 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 SPANXCQ9NY87 97 aa6.26□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 A0A0J9YWU9 116 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 IGLL5B9A064 214 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 APOMO95445 188 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 MIAQ16674 131 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 RETNQ9HD89 108 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.25□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.24□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.24□□□□□ -1.41
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TRBV10-1-201ENST00000390364 REG3AQ06141 175 aa6.24□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.24□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.24□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.24□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.24□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.23□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 A0A0B4J2C4 111 aa6.23□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 A4D1N5 150 aa6.23□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 COX7A2LO14548 114 aa6.23□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.23□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 Q6ZTC4 211 aa6.23□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 C5orf38Q86SI9 138 aa6.23□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 ERG28Q9UKR5 140 aa6.23□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.23□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.22□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 CRPP02741 224 aa6.22□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 CKS1BP61024 79 aa6.22□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.22□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.22□□□□□ -1.41
TRBV10-1-201ENST00000390364 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 COX6CP09669 75 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 CFC1BP0CG36 223 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 CFC1P0CG37 223 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 CXCL5P42830 114 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 PSMB2P49721 201 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 Q1RN00 199 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 MRAPQ8TCY5 172 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 LITAFQ99732 161 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.21□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.2□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 K7EIL1 84 aa6.2□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 LINC00158P58513 81 aa6.2□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.2□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.2□□□□□ -1.42
TRBV10-1-201ENST00000390364 Q8IZM0 81 aa6.2□□□□□ -1.42
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