RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.07□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 PRYO14603 147 aa6.06□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 NPBQ8NG41 125 aa6.06□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.06□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.05□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.05□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.05□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.05□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 G3V318 75 aa6.04□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 A8MU10 97 aa6.04□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 LYNX1P0DP58 116 aa6.04□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.04□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.03□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.03□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF843Q8N446 348 aa6.03□□□□□ -1.44
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NHLRC3-201ENST00000379599 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6□□□□□ -1.45
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NHLRC3-201ENST00000379599 C19orf84I3L1E1 186 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 CXCL6P80162 114 aa5.99□□□□□ -1.45
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NHLRC3-201ENST00000379599 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.98□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.98□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 Q6ZSN1 163 aa5.98□□□□□ -1.45
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NHLRC3-201ENST00000379599 IGHV3-11P01762 117 aa5.97□□□□□ -1.45
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NHLRC3-201ENST00000379599 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 ERC2-IT1O76042 136 aa5.96□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 BSPH1Q075Z2 132 aa5.96□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.96□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 COL12A1Q99715 3063 aa5.96□□□□□ -1.46
NHLRC3-201ENST00000379599 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.461e-6■■■□□ 14.9
NHLRC3-201ENST00000379599 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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