RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 C5orf38Q86SI9 138 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 DEFB123Q8N688 67 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJC13O75165 2243 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC730098B7Z3J9 87 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMGN1P05114 100 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 MGPP08493 103 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKAIN1P0CW23 69 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOCADQ5VW36 1801 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf54Q8WWF1 131 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAIMQ9NVQ4 179 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00474Q9P2X8 69 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 UQCR10Q9UDW1 63 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 MBD5Q9P267 1494 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHLPP1O60346 1717 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTAF1O14981 1849 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYOM1P52179 1685 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERC2O95714 4834 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 OOSP1A8MZH6 123 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLC1P0CG04 106 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 PP6455Q8WZ26 134 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPRR4Q96PI1 79 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 NF1P21359 2839 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf153Q5TBE3 101 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.47□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 PKHD1P08F94 4074 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 USH2AO75445 5202 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERC1Q15751 4861 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM24AA6NFZ4 105 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 F6UZH7 168 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 M0R2T5 61 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNAPC5O75971 98 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX8AP10176 69 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNG11P61952 73 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM223AQ8IWN6 122 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 USMG5Q96IX5 58 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRO1933Q9H354 126 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 TGP01266 2768 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 A2ML1A8K2U0 1454 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 RYR1P21817 5038 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX6CP09669 75 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMGXB3Q12766 1538 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHROOM2Q13796 1616 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 MANBALQ9NQG1 85 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAT1Q14517 4588 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 TET3O43151 1660 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF5Q12774 1597 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GWA3 101 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAPPC2P0DI81 140 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAP1L6A6NFF2 107 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q0VG73 95 aa-0.53□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms