RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313116.11

ZNF41-201, Transcript of zinc finger protein 41, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF41, Length 4,297 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF41-201ENST00000313116 TIMM17BO60830 172 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF41-201ENST00000313116 COX6A2Q02221 97 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF41-201ENST00000313116 AMELXQ99217 191 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF41-201ENST00000313116 KLK12Q9UKR0 248 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF41-201ENST00000313116 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF41-201ENST00000313116 Q9UF83 564 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF41-201ENST00000313116 A0A1B0GX51 115 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF41-201ENST00000313116 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
ZNF41-201ENST00000313116 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.03□□□□□ -1.28
ZNF41-201ENST00000313116 KALRNO60229 2985 aa7.02□□□□□ -1.28
ZNF41-201ENST00000313116 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.02□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.02□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 LINC01006Q8NI28 216 aa7.02□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 TMEM126AQ9H061 195 aa7.02□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.02□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 SPAG11BQ08648 103 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 TRACP01848 142 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 PRO0461Q9UI25 63 aa7.01□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 DEFB121Q5J5C9 76 aa7□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 CAMK2N2Q96S95 79 aa7□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.99□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 ZNF843Q8N446 348 aa6.99□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 CDIP1Q9H305 208 aa6.99□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.99□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 ATOX1O00244 68 aa6.99□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 REG3AQ06141 175 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 ATMQ13315 3056 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 TACC2O95359 2948 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 CCDC179H3BU77 68 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 CXCL5P42830 114 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 CCL18P55774 89 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 PLA2G2AP14555 144 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 KLK9Q2XQG4 91 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF41-201ENST00000313116 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 C6orf99Q4VX62 202 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.94□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 ZNF575Q86XF7 245 aa6.94□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.94□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 PSCAO43653 123 aa6.93□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 DIRC1Q969H9 104 aa6.93□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 ZZEF1O43149 2961 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 F8WEM9 126 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 LYRM9A8MSI8 78 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 UQCRQO14949 82 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 USP24Q9UPU5 2620 aa6.92□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 hADV29S1A0JD25 119 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 Q8N2B8 174 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 MRAPQ8TCY5 172 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 IGLV1-51P01701 117 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.91□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.9□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 LRBAP50851 2863 aa6.9□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 INAFM1C9JVW0 142 aa6.9□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 SMR3AQ99954 134 aa6.9□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 CITED1Q99966 193 aa6.9□□□□□ -1.3
ZNF41-201ENST00000313116 A0A087WZ39 114 aa6.9□□□□□ -1.31
ZNF41-201ENST00000313116 FHL2Q14192 279 aa6.9□□□□□ -1.31
ZNF41-201ENST00000313116 IMUPQ9GZP8 106 aa6.9□□□□□ -1.31
ZNF41-201ENST00000313116 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.9□□□□□ -1.31
ZNF41-201ENST00000313116 ITPR3Q14573 2671 aa6.9□□□□□ -1.31
ZNF41-201ENST00000313116 A0A087WYN8 130 aa6.9□□□□□ -1.31
ZNF41-201ENST00000313116 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms