RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288050.8

PDPR-201, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 9,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-201ENST00000288050 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.42□□□□□ -1.22
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PDPR-201ENST00000288050 XGP55808 180 aa7.42□□□□□ -1.22
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PDPR-201ENST00000288050 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.41□□□□□ -1.22
PDPR-201ENST00000288050 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.41□□□□□ -1.22
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PDPR-201ENST00000288050 A0A0J9YX75 114 aa7.41□□□□□ -1.22
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PDPR-201ENST00000288050 IGKV2-30P06310 120 aa7.4□□□□□ -1.23
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PDPR-201ENST00000288050 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDPR-201ENST00000288050 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDPR-201ENST00000288050 MSMPQ1L6U9 139 aa7.38□□□□□ -1.23
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PDPR-201ENST00000288050 Q6ZSR3 168 aa7.37□□□□□ -1.23
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PDPR-201ENST00000288050 IGLV1-44P01699 117 aa7.37□□□□□ -1.23
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PDPR-201ENST00000288050 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.36□□□□□ -1.23
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PDPR-201ENST00000288050 RITA1Q96K30 269 aa7.36□□□□□ -1.23
PDPR-201ENST00000288050 EP400Q96L91 3159 aa7.36□□□□□ -1.23
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PDPR-201ENST00000288050 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.32□□□□□ -1.24
PDPR-201ENST00000288050 LINC01554Q52M75 96 aa7.32□□□□□ -1.24
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PDPR-201ENST00000288050 M0QY20 66 aa7.31□□□□□ -1.24
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PDPR-201ENST00000288050 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPR-201ENST00000288050 C4orf26Q17RF5 130 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPR-201ENST00000288050 A0A087WYN8 130 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPR-201ENST00000288050 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDPR-201ENST00000288050 IGLV2-14P01704 120 aa7.25□□□□□ -1.25
PDPR-201ENST00000288050 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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