RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 LINC01600Q96MT4 127 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 Q9HAA7 133 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 TRIOO75962 3097 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GUV1 79 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 CCL18P55774 89 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 MUC4Q99102 2169 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 REG3AQ06141 175 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 MIFP14174 115 aa6.27□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.27□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 SORL1Q92673 2214 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 PDE6GP18545 87 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 DSCR8Q96T75 97 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 SPAG11BQ08648 103 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 LAMA1P25391 3075 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 ACACBO00763 2458 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 DEFB135Q30KP9 77 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 J3KT08 172 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 UQCRQO14949 82 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 NDUFC2O95298 119 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 Q6JHZ5 121 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 Q9UF83 564 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 NCR3O14931 201 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 LELP1Q5T871 98 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 VCANP13611 3396 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 ESM1Q9NQ30 184 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 hADV29S1A0JD25 119 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 DIRC1Q969H9 104 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 RMI2Q96E14 147 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC3-201ENST00000264345 TMEM258P61165 79 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 CCDC179H3BU77 68 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 KLK12Q9UKR0 248 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WYN8 130 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 CCKP06307 115 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 C5orf47Q569G3 176 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 FAM104AQ969W3 186 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 COX7BP24311 80 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 MUC3AQ02505 3323 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 Q8N814 137 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 F8WEM9 126 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 DEFB4AO15263 64 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 SLPIP03973 132 aa6.18□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.18□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 LY6G6DO95868 133 aa6.18□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 COX7CP15954 63 aa6.18□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 BRK1Q8WUW1 75 aa6.18□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 ZNF292O60281 2723 aa6.18□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 PLA2G2AP14555 144 aa6.18□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 C6orf99Q4VX62 202 aa6.17□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.17□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 F8WDY8 70 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 SERP2Q8N6R1 65 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HERC3-201ENST00000264345 A0A0U1RQV1 116 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 C20orf197Q8N268 126 aa6.15□□□□□ -1.43
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