RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 CXCL6P80162 114 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 Q8N9L7 120 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 RTTNQ86VV8 2226 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 LIMD2Q9BT23 127 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-201ENST00000261266 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-201ENST00000261266 IGKV2D-28P01615 120 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRB-201ENST00000261266 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP10-9P60411 292 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.33□□□□□ -1.4
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PTPRB-201ENST00000261266 CELA1Q9UNI1 258 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 A0A096LNI7 61 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZVQ6 151 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 AKAP6Q13023 2319 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 NACAE9PAV3 2078 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 SNURFQ9Y675 71 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZRU5 148 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 A6NED7 52 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 C22orf24Q9Y442 160 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-201ENST00000261266 RETNQ9HD89 108 aa6.28□□□□□ -1.4
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