RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.86□□□□□ -0.51
FCHO1-201ENST00000252771 SFTA2Q6UW10 78 aa11.86□□□□□ -0.51
FCHO1-201ENST00000252771 NDUFA1O15239 70 aa11.85□□□□□ -0.51
FCHO1-201ENST00000252771 A0A096LPF7 62 aa11.85□□□□□ -0.51
FCHO1-201ENST00000252771 H3BMG7 143 aa11.85□□□□□ -0.51
FCHO1-201ENST00000252771 KRTAP10-11P60412 298 aa11.84□□□□□ -0.51
FCHO1-201ENST00000252771 RNF183Q96D59 192 aa11.84□□□□□ -0.51
FCHO1-201ENST00000252771 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.84□□□□□ -0.51
FCHO1-201ENST00000252771 SPANXCQ9NY87 97 aa11.84□□□□□ -0.51
FCHO1-201ENST00000252771 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
FCHO1-201ENST00000252771 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.83□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.83□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 MIFP14174 115 aa11.83□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.83□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 Q9H8V8 135 aa11.83□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 PAX4O43316 350 aa11.82□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 PRSS2P07478 247 aa11.82□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 MIAQ16674 131 aa11.82□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 DAND5Q8N907 189 aa11.82□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 NPC2P61916 151 aa11.82□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 DAD1P61803 113 aa11.81□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.8□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 A0A0B4J2C4 111 aa11.8□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 TIMM17BO60830 172 aa11.8□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 RBX1P62877 108 aa11.8□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.8□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 IGHV3-33P01772 117 aa11.8□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.8□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 DNAH3Q8TD57 4116 aa11.79□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.79□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 MTURNQ8N3F0 131 aa11.79□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 PRO0461Q9UI25 63 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 MAST4O15021 2626 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 WFDC2Q14508 124 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-201ENST00000252771 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 A0A1B0GUV1 79 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 TMEM262E9PQX1 116 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 ATP5G1P05496 136 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 A0A0U1RRA0 63 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 F8W1H4 67 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 C3orf56Q8N813 242 aa11.75□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 H7C2G1 150 aa11.75□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.75□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 BAHCC1Q9P281 2608 aa11.75□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 TCL1BO95988 128 aa11.75□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 PSMB2P49721 201 aa11.75□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 Q8N3U1 123 aa11.75□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 ERG28Q9UKR5 140 aa11.74□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 RETNQ9HD89 108 aa11.74□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 A0A087WZ39 114 aa11.73□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 IFITM1P13164 125 aa11.73□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 HTN3P15516 51 aa11.73□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 C5orf38Q86SI9 138 aa11.73□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 CLPSL2Q6UWE3 100 aa11.73□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.73□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.73□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 COX7B2Q8TF08 81 aa11.73□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 TENM3Q9P273 2699 aa11.72□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.71□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 COL6A5A8TX70 2615 aa11.71□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 RNF151Q2KHN1 245 aa11.71□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 TOMM7Q9P0U1 55 aa11.71□□□□□ -0.53
FCHO1-201ENST00000252771 K7ERU9 68 aa11.71□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 HERV-K104P63124 156 aa11.71□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.71□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa11.7□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 XCL1P47992 114 aa11.7□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.7□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.69□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 ETDBQ3ZM63 59 aa11.69□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.69□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 G3V4G9 280 aa11.69□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 LYRM7Q5U5X0 104 aa11.69□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.68□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 Q1RN00 199 aa11.68□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 TRIAP1O43715 76 aa11.68□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 SS18Q15532 418 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 NOTCH1P46531 2555 aa11.67□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-201ENST00000252771 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-201ENST00000252771 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-201ENST00000252771 REG3AQ06141 175 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-201ENST00000252771 LELP1Q5T871 98 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-201ENST00000252771 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-201ENST00000252771 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-201ENST00000252771 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-201ENST00000252771 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-201ENST00000252771 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-201ENST00000252771 Q6ZTC4 211 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-201ENST00000252771 VPS25Q9BRG1 176 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-201ENST00000252771 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.8 ms