RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	UPK3B	Q9BT76	320 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A1B0GUV1	79 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	C3orf84	H3BNL1	204 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	BAALC	Q8WXS3	180 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A087WX48	190 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	ATP5L	O75964	103 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV3-30	P01768	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV3-33	P01772	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM141	Q96I45	108 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	C3orf79	P0CE67	100 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	AKR1D1	P51857	326 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM101	Q96IK0	257 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421		H0Y8G0	127 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	SIVA1	O15304	175 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTDAP	P60985	99 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421		Q6ZN92	141 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	AMELX	Q99217	191 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	NPS	P0C0P6	89 aa		12.02	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		12.02	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421		Q9H8V8	135 aa		12.02	□□□□□ -0.48
SPIN3-238	ENST00000640421	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	PRSS1	P07477	247 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	PKIA	P61925	76 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	VCX2	Q9H322	139 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	KLK12	Q9UKR0	248 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	CST9L	Q9H4G1	147 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	PMVK	Q15126	192 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	ODF1	Q14990	250 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	DNAH2	Q9P225	4427 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	ENHO	Q6UWT2	76 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	PRR34	Q9NV39	138 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	REG3A	Q06141	175 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	C12orf57	Q99622	126 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SPIN3-238	ENST00000640421	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	UBE2D1	P51668	147 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC01545	Q5VT33	79 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	PET117	Q6UWS5	81 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A0J9YXV3	536 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	LY6G6C	O95867	125 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421		F8VRH5	84 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	COX6A2	Q02221	97 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	PYY3	Q5JQD4	70 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	C11orf86	A6NJI1	115 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	CRP	P02741	224 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	IGLC3	P0DOY3	106 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	SMIM6	P0DI80	62 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421		Q9HAA7	133 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CCL25	O15444	150 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	SCGB1D1	O95968	90 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	ATOH7	Q8N100	152 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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