RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM141	Q96I45	108 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280		F8VRH5	84 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	COL6A5	A8TX70	2615 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	OR11H2	Q8NH07	326 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	GAGE13	Q4V321	117 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PLN	P26678	52 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	FHL2	Q14192	279 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	GAGE12J	A6NER3	117 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	GAGE4	Q13068	117 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	GAGE5	Q13069	117 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PMVK	Q15126	192 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	HIST1H4G	Q99525	98 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PRO0461	Q9UI25	63 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	DEFB4A	O15263	64 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	UBE2D3	P61077	147 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	UBE2D2	P62837	147 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	CKS1B	P61024	79 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	SVIP	Q8NHG7	77 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	RNF183	Q96D59	192 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1B0GWB2	263 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	MTURN	Q8N3F0	131 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280		Q8NAQ8	132 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	FAM104A	Q969W3	186 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	MIF	P14174	115 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	C11orf86	A6NJI1	115 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280		A8MZ25	164 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	VCX2	Q9H322	139 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	APOM	O95445	188 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	FOXI1	Q12951	378 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	AMELX	Q99217	191 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	CELA1	Q9UNI1	258 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNM1-222	ENST00000636280	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00694	P0DN24	101 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	CRYBA4	P53673	196 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	DAD1	P61803	113 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280		Q6ZUT4	128 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	RETN	Q9HD89	108 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	PRO0255	Q9UI72	69 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	CDIP1	Q9H305	208 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280		A0A0J9YXV3	536 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	GYPE	P15421	78 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM243	Q9BU79	118 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	SPINK8	P0C7L1	97 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280		A6NJY4	79 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	MDFI	Q99750	246 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DNM1-222	ENST00000636280	PAX4	O43316	350 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DNM1-222	ENST00000636280	ATP5G1	P05496	136 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DNM1-222	ENST00000636280	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DNM1-222	ENST00000636280	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DNM1-222	ENST00000636280	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DNM1-222	ENST00000636280	PSMB2	P49721	201 aa		11.14	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms