RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634931.1

SMARCA2-231, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SMARCA2, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-231	ENST00000634931	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	IMMP2L	Q96T52	175 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	OTOR	Q9NRC9	128 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931		A0A0J9YX75	114 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931		A0A1B0GW15	77 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931		M0R2Z0	102 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	TCRA	P04437	139 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	AZU1	P20160	251 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	S100A12	P80511	92 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	BLNK	Q8WV28	456 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	DERL1	Q9BUN8	251 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	RBAKDN	A6NC62	111 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931		M0R036	132 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	ISLR	O14498	428 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	LTA	P01374	205 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	MT-ND4L	P03901	98 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCL18	P55774	89 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	ELOB	Q15370	118 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	C5orf47	Q569G3	176 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	RNF182	Q8N6D2	247 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	FMC1	Q96HJ9	113 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	LINC01587	Q99440	93 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	OSTC	Q9NRP0	149 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC17A3	O00476	420 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	AKR1C3	P42330	323 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	PSMB2	P49721	201 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	GNG4	P50150	75 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	ADIRF	Q15847	76 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	CENPW	Q5EE01	88 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	AMTN	Q6UX39	209 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	BAGE2	Q86Y30	109 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	SFRP2	Q96HF1	295 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	BIN3	Q9NQY0	253 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF492	Q9P255	531 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	NAGK	Q9UJ70	344 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931		V9GYV3	84 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	HSPG2	P98160	4391 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SMARCA2-231	ENST00000634931	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931		A0A0J9YY99	117 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931		M0R3E3	92 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	NDUFS5	O43920	106 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGKV2D-28	P01615	120 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	TYMS	P04818	313 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	ATP5G1	P05496	136 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	CXCL1	P09341	107 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	CSN1S1	P47710	185 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	UBE2G1	P62253	170 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	GNG5	P63218	68 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF738	Q8NE65	137 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	BTF3L4	Q96K17	158 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	LINC00477	Q96M19	166 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	IL36B	Q9NZH7	164 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931		H7BYZ3	331 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	CRIP1	P50238	77 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	ESRG	Q1W209	222 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	COX19	Q49B96	90 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931		Q86TA4	180 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SMARCA2-231	ENST00000634931	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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