RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	OTOR	Q9NRC9	128 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	PEMT	Q9UBM1	199 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495		F8W735	103 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	C5orf38	Q86SI9	138 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	HTN1	P15515	57 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	HERVK_113	P61574	105 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	C16orf92	Q96LL3	132 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	METTL26	Q96S19	204 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0B4J2C4	111 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf195	Q5TG92	126 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495		Q9H3A6	140 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-33	P01772	117 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	DSCR8	Q96T75	97 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BUA1	57 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-30	P01768	117 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	PATE2	Q6UY27	113 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	PRNT	Q86SH4	94 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		5.34	□□□□□ -1.55
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV2-11	P01706	119 aa		5.34	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		5.34	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	C20orf173	Q96LM9	149 aa		5.34	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0J9YY99	117 aa		5.33	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5.33	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495		F6UB75	175 aa		5.33	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5.33	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	SMKR1	H3BMG3	65 aa		5.33	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB131A	P59861	70 aa		5.33	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		5.33	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF182	Q8N6D2	247 aa		5.33	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	RETN	Q9HD89	108 aa		5.33	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	ANK2	Q01484	3957 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	KNCN	A6PVL3	124 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB4A	O15263	64 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	LAGE3	Q14657	143 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	SERP2	Q8N6R1	65 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	THAP8	Q8NA92	274 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	UPK3B	Q9BT76	320 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	TENM3	Q9P273	2699 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	EPM2A	B3EWF7	344 aa		5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495		H7C423	109 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFA4	O00483	81 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	GPHB5	Q86YW7	130 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	C17orf77	Q96MU5	243 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFC2	O95298	119 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM236C	P0DP71	79 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF185	Q96GF1	192 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		5.31	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495		K7EIL1	84 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	NPC2	P61916	151 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495		Q1RN00	199 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB135	Q30KP9	77 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	CNFN	Q9BYD5	112 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		5.3	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV1-51	P01701	117 aa		5.29	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	COX6C	P09669	75 aa		5.29	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	CRIP1	P50238	77 aa		5.29	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R3E3	92 aa		5.29	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		5.29	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	XCL2	Q9UBD3	114 aa		5.29	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	PRM2	P04554	102 aa		5.28	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		5.28	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		5.28	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		5.28	□□□□□ -1.56
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF580	Q9UK33	172 aa		5.28	□□□□□ -1.56

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