RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 WFDC2Q14508 124 aa14.91□□□□□ -0.02
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CTDP1-208ENST00000613122 PIEZO1Q92508 2521 aa14.9□□□□□ -0.02
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CTDP1-208ENST00000613122 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDP1-208ENST00000613122 BPY2O14599 106 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.89□□□□□ -0.03
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CTDP1-208ENST00000613122 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDP1-208ENST00000613122 CD164L2Q6UWJ8 174 aa14.87□□□□□ -0.03
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CTDP1-208ENST00000613122 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.84□□□□□ -0.03
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CTDP1-208ENST00000613122 UPK3BQ9BT76 320 aa14.83□□□□□ -0.03
CTDP1-208ENST00000613122 C10orf142B7Z368 130 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.82□□□□□ -0.04
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CTDP1-208ENST00000613122 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.82□□□□□ -0.04
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CTDP1-208ENST00000613122 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDP1-208ENST00000613122 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.81□□□□□ -0.04
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CTDP1-208ENST00000613122 PTH2Q96A98 100 aa14.77□□□□□ -0.04
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CTDP1-208ENST00000613122 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDP1-208ENST00000613122 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.75□□□□□ -0.05
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CTDP1-208ENST00000613122 SS18L2Q9UHA2 77 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 SPINK6Q6UWN8 80 aa14.7□□□□□ -0.06
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CTDP1-208ENST00000613122 CCKP06307 115 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 SCXQ7RTU7 201 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 LRP4O75096 1905 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 IGF2RP11717 2491 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 HRCT1Q6UXD1 115 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PPR1 153 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 TRIAP1O43715 76 aa14.67□□□□□ -0.06
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