RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.33□□□□□ -0.6
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PDE4C-211ENST00000597360 DCANP1Q8TF63 244 aa11.33□□□□□ -0.6
PDE4C-211ENST00000597360 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.33□□□□□ -0.6
PDE4C-211ENST00000597360 USP17L23D6RBM5 183 aa11.32□□□□□ -0.6
PDE4C-211ENST00000597360 C20orf197Q8N268 126 aa11.32□□□□□ -0.6
PDE4C-211ENST00000597360 FAM223BA6NKX1 122 aa11.31□□□□□ -0.6
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PDE4C-211ENST00000597360 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.31□□□□□ -0.6
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PDE4C-211ENST00000597360 PKIGQ9Y2B9 76 aa11.31□□□□□ -0.6
PDE4C-211ENST00000597360 PAX4O43316 350 aa11.31□□□□□ -0.6
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PDE4C-211ENST00000597360 SERP2Q8N6R1 65 aa11.31□□□□□ -0.6
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PDE4C-211ENST00000597360 C5orf56Q8N8D9 126 aa11.3□□□□□ -0.6
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PDE4C-211ENST00000597360 BLCAPP62952 87 aa11.29□□□□□ -0.6
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PDE4C-211ENST00000597360 CXCL5P42830 114 aa11.27□□□□□ -0.6
PDE4C-211ENST00000597360 COX6A2Q02221 97 aa11.27□□□□□ -0.6
PDE4C-211ENST00000597360 LINC00846Q9NV44 126 aa11.27□□□□□ -0.6
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PDE4C-211ENST00000597360 HILS1P60008 231 aa11.27□□□□□ -0.61
PDE4C-211ENST00000597360 COL12A1Q99715 3063 aa11.27□□□□□ -0.61
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PDE4C-211ENST00000597360 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PDE4C-211ENST00000597360 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PDE4C-211ENST00000597360 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.26□□□□□ -0.61
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PDE4C-211ENST00000597360 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.26□□□□□ -0.61
PDE4C-211ENST00000597360 NDUFA1O15239 70 aa11.26□□□□□ -0.61
PDE4C-211ENST00000597360 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.26□□□□□ -0.61
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PDE4C-211ENST00000597360 C9orf85Q96MD7 179 aa11.25□□□□□ -0.61
PDE4C-211ENST00000597360 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.25□□□□□ -0.61
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PDE4C-211ENST00000597360 C5orf38Q86SI9 138 aa11.24□□□□□ -0.61
PDE4C-211ENST00000597360 UBE2L6O14933 153 aa11.23□□□□□ -0.61
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PDE4C-211ENST00000597360 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.19□□□□□ -0.62
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PDE4C-211ENST00000597360 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.18□□□□□ -0.62
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PDE4C-211ENST00000597360 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.18□□□□□ -0.62
PDE4C-211ENST00000597360 LINC01600Q96MT4 127 aa11.18□□□□□ -0.62
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PDE4C-211ENST00000597360 ZNF415Q09FC8 603 aa11.17□□□□□ -0.62
PDE4C-211ENST00000597360 FHL2Q14192 279 aa11.17□□□□□ -0.62
PDE4C-211ENST00000597360 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.17□□□□□ -0.62
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