RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 AKAP9Q99996 3911 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 RS1O15537 224 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 UBL5Q9BZL1 73 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF580Q9UK33 172 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 C1orf195Q5TG92 126 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 H0YGX0 51 aa4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 FRYQ5TBA9 3013 aa4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
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SEH1L-210ENST00000592582 A0A0U1RRA0 63 aa4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 PRYO14603 147 aa4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 SEC61GP60059 68 aa4.42□□□□□ -1.7
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SEH1L-210ENST00000592582 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 ZFHX3Q15911 3703 aa4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 GNRH2O43555 120 aa4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 C20orf197Q8N268 126 aa4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 DCANP1Q8TF63 244 aa4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 BRK1Q8WUW1 75 aa4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 C20orf173Q96LM9 149 aa4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 VPS13AQ96RL7 3174 aa4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 PSMB8P28062 276 aa4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 TSHBP01222 138 aa4.4□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.4□□□□□ -1.7
SEH1L-210ENST00000592582 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.4□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.4□□□□□ -1.71
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SEH1L-210ENST00000592582 BLCAPP62952 87 aa4.4□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 Q9H8V8 135 aa4.4□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.4□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.39□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 AMELXQ99217 191 aa4.39□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.39□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 NDUFC1O43677 76 aa4.39□□□□□ -1.71
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SEH1L-210ENST00000592582 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.39□□□□□ -1.71
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SEH1L-210ENST00000592582 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.38□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 C2orf48Q96LS8 159 aa4.38□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 C9orf85Q96MD7 179 aa4.38□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa4.38□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 TRBV12-3P01733 135 aa4.38□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.38□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 NBASA2RRP1 2371 aa4.38□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.38□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 IGHV4-59P01825 116 aa4.38□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 WFDC11Q8NEX6 87 aa4.38□□□□□ -1.71
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SEH1L-210ENST00000592582 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.37□□□□□ -1.71
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SEH1L-210ENST00000592582 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.37□□□□□ -1.71
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SEH1L-210ENST00000592582 LINC00158P58513 81 aa4.37□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 F6UB75 175 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 FRYLO94915 3013 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 HTN1P15515 57 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 XCL1P47992 114 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 XCL2Q9UBD3 114 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 A0A087WVE0 104 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 KLLNB2CW77 178 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 M0QY20 66 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 BCE1O60756 84 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 Q6ZSV7 163 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 UBE2L6O14933 153 aa4.36□□□□□ -1.71
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