RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa16■□□□□ 0.15
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CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H2BNQ99877 126 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H2BMQ99879 126 aa16■□□□□ 0.15
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CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
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CAPNS1-214ENST00000592483 KLK12Q9UKR0 248 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPNS1-214ENST00000592483 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa15.85■□□□□ 0.13
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CAPNS1-214ENST00000592483 PRR34Q9NV39 138 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.83■□□□□ 0.12
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CAPNS1-214ENST00000592483 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa15.81■□□□□ 0.12
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CAPNS1-214ENST00000592483 REG3AQ06141 175 aa15.81■□□□□ 0.12
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CAPNS1-214ENST00000592483 Q6ZUT4 128 aa15.81■□□□□ 0.12
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CAPNS1-214ENST00000592483 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa15.81■□□□□ 0.12
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CAPNS1-214ENST00000592483 J3QL48 77 aa15.8■□□□□ 0.12
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CAPNS1-214ENST00000592483 LEPROTL1O95214 131 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-214ENST00000592483 ENHOQ6UWT2 76 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX43Q6ZNM6 134 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM104AQ969W3 186 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-214ENST00000592483 C2orf88Q9BSF0 95 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-214ENST00000592483 VCX2Q9H322 139 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPB8Q9UJY1 196 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-214ENST00000592483 COX11Q9Y6N1 276 aa15.77■□□□□ 0.12
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