RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587009.5

UBXN6-203, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 1,967 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-203ENST00000587009 LYRM7Q5U5X0 104 aa14.72□□□□□ -0.05
UBXN6-203ENST00000587009 NDUFA7O95182 113 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN6-203ENST00000587009 PRO0461Q9UI25 63 aa14.71□□□□□ -0.05
UBXN6-203ENST00000587009 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 Q6ZTI0 123 aa14.71□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 PRO1854Q9UHT4 67 aa14.71□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 K7EQD1 137 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.7□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 A4D1N5 150 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 TIRAPP58753 221 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.69□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 NF1P21359 2839 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 C16orf74Q96GX8 76 aa14.68□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.67□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 A0A0B4J2C4 111 aa14.66□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 SPINK8P0C7L1 97 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 PSMB2P49721 201 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 LITAFQ99732 161 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 WFDC10AQ9H1F0 79 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBXN6-203ENST00000587009 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 CIDEAO60543 219 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 SMAGPQ0VAQ4 97 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 ETDBQ3ZM63 59 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 SFTA2Q6UW10 78 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 SPANXCQ9NY87 97 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 JMJD1CQ15652 2540 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 J3QR89 54 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 ZFAND6Q6FIF0 208 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 IGHV3-33P01772 117 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 MTURNQ8N3F0 131 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 HERVK_113P63121 156 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 GAGE12JA6NER3 117 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 LINC00694P0DN24 101 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 GAGE4Q13068 117 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 GAGE5Q13069 117 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 ERG28Q9UKR5 140 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 GAGE7O76087 117 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 TCL1BO95988 128 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 GAGE12FP0CL80 117 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 GAGE12GP0CL81 117 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 GAGE12IP0CL82 117 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 A8MZ25 164 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 TIMM17BO60830 172 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 MIAQ16674 131 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.58□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 COX6A2Q02221 97 aa14.58□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.58□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.58□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 TMEM101Q96IK0 257 aa14.58□□□□□ -0.07
UBXN6-203ENST00000587009 PRSS2P07478 247 aa14.58□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.58□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 NDUFA1O15239 70 aa14.57□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa14.57□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.56□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 RNF183Q96D59 192 aa14.56□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 TMEM243Q9BU79 118 aa14.55□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 H7C423 109 aa14.54□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 KRTAP10-3P60369 221 aa14.54□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 IFITM1P13164 125 aa14.54□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.53□□□□□ -0.08
UBXN6-203ENST00000587009 UBE2L6O14933 153 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.4 ms