RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-214ENST00000583153 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-214ENST00000583153 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-214ENST00000583153 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-214ENST00000583153 A8MWL6 223 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 K7ERU9 68 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 PSCAO43653 123 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 SEC11AP67812 179 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 MLST8Q9BVC4 326 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP10-2P60368 255 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 HBBP68871 147 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF56Q15929 161 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 MPV17L2Q567V2 206 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 ATOH7Q8N100 152 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 TPPP3Q9BW30 176 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 Q9HAA7 133 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GW15 77 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 HIGD1CA8MV81 97 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 F5H697 171 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 H3BRM9 83 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 LEPROTL1O95214 131 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM17P0DL12 118 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 COX8AP10176 69 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 LINC01545Q5VT33 79 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZVH6 145 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 Q9UF83 564 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 HSPG2P98160 4391 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087WTM6 91 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 RNF151Q2KHN1 245 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 VPS25Q9BRG1 176 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf118A6NHY6 69 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 SNAI2O43623 268 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 P01737 135 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087WX48 190 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 hDV102S1A0JD36 115 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 GAGE10A6NGK3 116 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM238C9JI98 176 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM262E9PQX1 116 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 CDK2AP2O75956 126 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 MGPP08493 103 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00694P0DN24 101 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 CAMPP49913 170 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 GTSF1Q8WW33 167 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 AP1S3Q96PC3 154 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 TM2D2Q9BX73 214 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 A6NDN8 102 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 SCGB1A1P11684 91 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2D3P61077 147 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2D2P62837 147 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 CACNG7P62955 275 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 RIGQ13278 110 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 K7EP34 96 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 FGF6P10767 208 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 LAGE3Q14657 143 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 KLK12Q9UKR0 248 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRM-214ENST00000583153 H7C1H1 209 aa5.56□□□□□ -1.52
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