RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	AMELX	Q99217	191 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	VCX2	Q9H322	139 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	HERVK_113	P61574	105 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279		A8MZ25	164 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	SCGB1A1	P11684	91 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	CRYBA4	P53673	196 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	UBE2D3	P61077	147 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	UBE2D2	P62837	147 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	B9D2	Q9BPU9	175 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279		A0A0J9YXV3	536 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279		A6NDN8	102 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279		X6R8D5	127 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	GAGE12J	A6NER3	117 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF815P	A8K554	130 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	GCSH	P23434	173 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	FXYD2	P54710	66 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	GAGE4	Q13068	117 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	GAGE5	Q13069	117 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	DEFB135	Q30KP9	77 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM223	A0PJW6	202 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	TAL2	Q16559	108 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279		Q6ZUT4	128 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	TM2D2	Q9BX73	214 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	CEND1	Q8N111	149 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	TG	P01266	2768 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TCF4-231	ENST00000566279	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		7.15	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		7.15	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279		H3BRM9	83 aa		7.15	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	FHL2	Q14192	279 aa		7.15	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		7.15	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		7.15	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	TENM3	Q9P273	2699 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279		J3QQQ9	107 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	LEPROT	O15243	131 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	LINC00694	P0DN24	101 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	APOC4	P55056	127 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	DEFB130B	P0DP73	79 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	DEFB130A	P0DP74	79 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	HIST1H4G	Q99525	98 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	C9orf118	A6NHY6	69 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	UBE2D1	P51668	147 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279		A0A0J9YY99	117 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279		A0A1B0GV72	72 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279		K7ERJ3	54 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	DEFB4A	O15263	64 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	SMIM13	P0DJ93	91 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	RAB37	Q96AX2	223 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	SPATA25	Q9BR10	227 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM243	Q9BU79	118 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	RNF183	Q96D59	192 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279		H3BUT2	72 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	TIRAP	P58753	221 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TCF4-231	ENST00000566279	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		7.09	□□□□□ -1.28
TCF4-231	ENST00000566279	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		7.09	□□□□□ -1.28
TCF4-231	ENST00000566279	LYRM9	A8MSI8	78 aa		7.09	□□□□□ -1.28
TCF4-231	ENST00000566279	C12orf74	Q32Q52	190 aa		7.09	□□□□□ -1.28
TCF4-231	ENST00000566279	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.28
TCF4-231	ENST00000566279	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		7.09	□□□□□ -1.28
TCF4-231	ENST00000566279	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.28
TCF4-231	ENST00000566279		A0A1B0GWB2	263 aa		7.08	□□□□□ -1.28

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