RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRD	P23468	1912 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	DOCK1	Q14185	1865 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		1.21	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00575	Q6W349	94 aa		1.21	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL19	Q99731	98 aa		1.21	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		1.21	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	FBN3	Q75N90	2809 aa		1.21	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	1.21	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	1.21	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	PARP14	Q460N5	1801 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957		F8VRH5	84 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	UQCR11	O14957	56 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLC2	P0DOY2	106 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLC3	P0DOY3	106 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	NMS	Q5H8A3	153 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00643	Q86TS7	51 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	MED12L	Q86YW9	2145 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957		Q96NJ1	140 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	MYH8	P13535	1937 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCA8	O94911	1581 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		1.2	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A096LNT2	108 aa		1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	C10orf142	B7Z368	130 aa		1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R135	149 aa		1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	FXYD1	O00168	92 aa		1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	WFDC2	Q14508	124 aa		1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMG4	Q5JS54	123 aa		1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	BAGE3	Q86Y29	109 aa		1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	CUX1	P39880	1505 aa		1.19	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	CIT	O14578	2027 aa		1.18	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		1.18	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	CLIP1	P30622	1438 aa		1.18	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF815P	A8K554	130 aa		1.18	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	PDCD5	O14737	125 aa		1.18	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	COX17	Q14061	63 aa		1.18	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		1.18	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	BAGE2	Q86Y30	109 aa		1.18	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRR4	Q96PI1	79 aa		1.18	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00846	Q9NV44	126 aa		1.18	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		1.18	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTS12	P58397	1594 aa		1.17	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	DOCK2	Q92608	1830 aa		1.17	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		1.17	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM223B	A6NKX1	122 aa		1.17	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	MGP	P08493	103 aa		1.17	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF137P	P52743	207 aa		1.17	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		1.17	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	1.17	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		1.17	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		1.17	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNA1G	O43497	2377 aa		1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957		E9PCH4	1651 aa		1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP12-4	P60329	112 aa		1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB119	Q8N690	84 aa		1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	MPDZ	O75970	2070 aa		1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		1.16	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	RP1	P56715	2156 aa		1.15	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	1.15	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		1.15	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		1.15	□□□□□ -2.22
AKAP13-223	ENST00000560957	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GWA3	101 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957		F8WEM9	126 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	SFTA2	Q6UW10	78 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	COL4A1	P02462	1669 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		1.15	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		1.14	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	SCN7A	Q01118	1682 aa		1.14	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		1.14	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		1.14	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BUT2	72 aa		1.14	□□□□□ -2.23
AKAP13-223	ENST00000560957	NCR3	O14931	201 aa		1.14	□□□□□ -2.23

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